Razlika med Transposon in Retrotransposon

Transposon proti Retrotransposonu

Transposoni in retrotranspozoni so genetska komponenta DNK, med njimi pa obstajajo velike razlike. Procentualna prisotnost teh genetskih materialov se med posameznimi vrstami razlikuje, njihove funkcije pa določajo usode organizma z mutacijami in drugimi fenotipsko pomembnimi spremembami. Transposoni in retrotransposoni so geni ali zbirke določenih genov, ki se nahajajo v verigah DNK, in spremembe njihovih lokacij so bile glavni vzrok za te posledice. Vendar pa ta članek namerava na kratko obravnavati funkcije teh genov in predstavlja primerjavo med transpozoni in retrotranspozoni.

Kaj je Transposon?

Transposoni so zanimivi drobci ali segmenti DNK z možnostjo spreminjanja lokacije verige DNA v obliki mehanizma za rezanje in lepljenje. Zaradi mobilne narave transpozonov so ti znani kot skakalni geni. Transposoni sta dve glavni vrsti, imenovani Transposoni razreda I in Transposoni razreda II. Običajno se vrsta razreda II imenuje kot transpozoni, vrsta razreda I pa retrotransposoni. Procese rezanja in lepljenja mobilnih segmentov DNK uravnava encim transpozaza. Encim se veže na oba konca transposona in prereže fosfodiesterske vezi verige DNA, izolira transposon, ga premakne na ciljno mesto in se veže na novo lokacijo. Vendar je ta postopek zanimiv za razumevanje, saj se nekateri transpozoni lahko premaknejo na določene lokacije le zaradi nezdružljivosti osnovnih zaporedij s ciljnim mestom. Geni z enim koncem enega samega niza imajo isto bazno zaporedje z drugim koncem drugega enojnega niza so transpozoni z lepljivimi robovi, ker se lahko vežejo na mesta ciljne verige DNA z istim zaporedjem baz kot v lepljivih koncih . Vendar lahko ta mobilnost genov povzroči spremembe genotipa in tudi v fenotipu organizma. Znanstveniki, ki so izumili o transpozonih in gensko spremenjeni hrani in organizmih v skladu s prednostnimi prilagoditvami, so bili nato na voljo. Visoko produktivni kmetijski pridelki, antibiotiki z zdravilnimi lastnostmi, živinoreje so bili nekateri od ugodno razvitih izdelkov po iznajdbi transpozonov Barbare McClintock v 40. letih 20. stoletja..

Kaj je Retrotransposon?

Retrotransposozoni so transpozoni I. razreda, ki se skozi mehanizem kopiranja in lepljenja gibljejo skozi genom. Mehanizem mobilnosti retrotransposonov vključuje nekaj večjih korakov, kot so kopiranje genskega segmenta DNA verige v RNA, prenos kopije RNA na ciljno mesto, prepisovanje sekvence RNA nazaj v DNK z uporabo reverzne transkriptaze in vstavitev gena na novo lokacijo verige DNA genoma. Oba konca teh retrotranspozonov imata običajno dolge končne ponovitve s približno 1000 baznimi pari, ki se uporabljajo kot identifikacijske lastnosti teh genov. Ti geni se zlahka amplificirajo znotraj genoma, odstotek retrotransposonov v človeškem genomu pa je približno 50%. Ti so lahko zelo nevarni, saj imajo povzročitelji AIDS-a, HIV-a in T-celične levkemije retrotransposoni v svojih genoma RNA. Pravzaprav lahko ti virusi z uporabo povratne transkriptaze in integraze vežejo retrotransposozone na katerem koli mestu človekovih verig DNK. Encim integraze deluje enako kot transpozaza v transpozonih razreda II.