Razlika med aktivnim spletnim mestom in spletnim mestom, ki zavezuje

The ključna razlika med aktivnim spletnim mestom in zavezujočim spletnim mestom je to aktivno mesto pomaga katalizirati kemijsko reakcijo, medtem ko vezno mesto pomaga pri vezavi liganda na veliko molekulo.

Vezno mesto je območje proteina, DNK ali RNK, na katero se lahko ligand veže. Encimi so beljakovine. Aktivno mesto je območje na encimu, na katero se lahko substrati vežejo, da se lahko izvede kemična reakcija. Ta specifična regija ima tudi mesto vezave skupaj s katalitičnim mestom. Zato vezivna mesta pomagajo le pri vezavi liganda na veliko molekulo, medtem ko aktivna mesta pomagajo tako vezavo liganda na veliko molekulo, medtem ko se podvrže katalizirani kemični reakciji.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je aktivno spletno mesto
3. Kaj je mesto vezave
4. Primerjava ob strani - spletno mesto Active Site vs vezanje v tabeli
5. Povzetek

Kaj je aktivno spletno mesto?

Aktivno mesto je regija na encimu, na katero se substrati kemijske reakcije vežejo, da bi izvedli katalizirano kemično reakcijo. to regijo sestavljata dve podregiji kot vezno mesto in katalitično mesto. Mesto vezave vsebuje nekaj ostankov, ki lahko pomagajo vezavo substrata (reaktantov) na encim. Katalitično mesto pomaga pri kataliziranju kemične reakcije. Poleg tega je ta regija v primerjavi s celotnim volumnom encima zelo majhna; približno 10-20% celotne prostornine encima.

Slika 01: Mesto vezave in Katalitično mesto aktivnega mesta

Običajno aktivno mesto vsebuje 3-4 aminokisline. preostale aminokisline v encimu, ki sodelujejo pri vzdrževanju terciarne strukture encima. Še pomembneje je, da ima aktivno mesto poseben dizajn, ki se lahko prilega točno določeni podlagi. Zato ti encimi reagirajo le s posebnimi substrati. Toda včasih encimi za svoje delovanje potrebujejo kofaktorje. Glavna funkcija aktivnega mesta je zmanjšati aktivacijsko energijo kemične reakcije in s tem povečati hitrost reakcije.

Kaj je mesto vezave?

Mesto vezanja je regija na proteinu, DNK ali RNA, na katero se lahko ligandi vežejo. Tam lahko ligand s tem mestom tvori kemično vez. Te regije kažejo posebnost; določen ligand se bo vezal na določeno vezavno mesto. Zato je to mesto merilo vrst ligandov, ki se lahko vežejo z molekulo.

Poleg tega te regije pogosto uporabljamo za funkcijsko karakterizacijo biomolekul. Na primer, lahko označimo funkcionalnost aktivnega spletnega mesta prek njegovega zavezujočega mesta. Poleg tega je v primeru DNK specifična vrsta mesta vezave transkripcijski faktor, ki je prisoten na DNK.

Kakšna je razlika med Active Site in Binding Site?

Aktivno mesto je regija na encimu, na katero se vežejo substrati kemijske reakcije, da se izvede katalizirana kemijska reakcija, medtem ko je mesto vezave območje na protein, DNK ali RNA, na katero se ligandi lahko vežejo. To je ključna razlika med aktivnim in zavezujočim spletnim mestom. Poleg tega so aktivna mesta prisotna v encimih in pomagajo povečati hitrost reakcije določene kemijske reakcije s pomočjo zmanjšanja aktivacijske energijske ovire te reakcije. Po drugi strani so vezna mesta odgovorna za vezavo določenega liganda z določeno molekulo.

Spodnja infografija prikazuje tabelarno razliko med aktivnim spletnim mestom in zavezujočim spletnim mestom.

Povzetek - Active Site vs Binding Site

Aktivna mesta so področja encimov, ki lahko povečajo hitrost kemijske reakcije z zmanjšanjem aktivacijske energijske ovire. Vezno mesto je katero koli območje, na katero se lahko ligand veže. Aktivno spletno mesto vsebuje tudi zavezujoče mesto. Razlika med aktivnim spletnim mestom in veznimi mesti je v obstoju in funkcionalnosti. Zato je ključna razlika med aktivnim mestom in vezivnim mestom ta, da aktivno mesto pomaga katalizirati kemijsko reakcijo, medtem ko vezivno mesto pomaga pri vezavi liganda na veliko molekulo.

Referenca:

1. "Aktivno spletno mesto." Wikipedia, fundacija Wikimedia, 24. julij 2018. Dostopno tukaj 
2. "Mesto zavezujočega." Wikipedia, fundacija Wikimedia, 28. avgust 2018. Dostopno tukaj 

Vljudnost slik:

1. "Enzimska struktura" avtorja Thomas Shafee - lastno delo, (CC BY 4.0) prek Commons Wikimedia