Razlika med faktorjem YAC in faktorjem M13

Ključna razlika - YAC v primerjavi z M13 Phage Vector
 

Kloniranje DNK je pomemben postopek, ki omogoča razmnoževanje pomembnih fragmentov DNK v organizmih. Za ustvarjanje rekombinantne DNK, ki se transformira v gostiteljski organizem, je potrebno združiti določeno DNK z vektorsko DNK. Vektor je molekula DNA, ki deluje kot nosilec tujega genskega materiala v drugo celico ali organizem. Moral bi biti zmožen razmnoževanja v gostiteljskem organizmu in izdelati več kopij rekombinantne DNK. Obstajajo različne vrste vektorjev, ki se uporabljajo pri kloniranju DNK. Kvasni umetni kromosom (YAC) in fazni vektor M13 sta dve vrsti. Ključna razlika med faktorjem vektorja YAC in M13 je ta YAC je umetni kromosom, ki se razmnožuje v celicah kvasovk medtem Fazni vektor M13 je enojna verižna krožna DNA bakteriofaga M13, ki se razmnožuje v E Coli celice.

VSEBINA
1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je YAC
3. Kaj je fazni vektor M13
4. Primerjava ob strani - YAC proti M13 Phage Vector
5. Povzetek

Kaj je YAC Vector?

YAC je umetno zgrajen kromosom, ki lahko prenaša velik del tuje DNK in se razmnožuje v celicah kvasovk. Ima centromere, telomere in avtonomno replicirajoče sekvence, ki so bistvene za podvajanje in stabilnost. YAC mora imeti tudi selektivni marker ali markerje in mesta omejevanja, da postane učinkovit vektor kloniranja. V sekvenco YAC lahko vstavimo velike sekvence od 1000 kb do 2000 kb in jih prenesemo v kvas.

Slika 01: Vektor YAC

Kaj je fazni vektor M13?

Bakteriofag M13 je virus, ki okuži in se razmnožuje v E Coli. Genom bakterije M13 bakteriofaga je majhne velikosti, približno 6,7 kb. To je enojna, okrogla DNK s pozitivnim občutkom. Ta virus posebej okuži E Coli bakterije skozi F pilus. Ko vstopi v ssDNA v bakterijo, sintetizira njen komplementarni niz in postane dsDNA ali replikativna oblika (RF) M13. RF se lahko v organizmu gostitelja obnaša kot plazmid. DsDNA se podvaja znotraj E Coli in proizvaja ssDNA, ki nosi nove fage. Ti novi fagi se nenehno sproščajo iz E Coli ne da bi ubil gostiteljsko celico. Vendar okužba upočasni rast E Coli. dsDNA lahko ekstrahiramo iz bakterijskih celic in jo uporabimo kot vektorje pri kloniranju DNK. Znani so kot fazni vektorji M13. Z njimi je mogoče enostavno manipulirati in jih uporabljati podobno kot plazmidni vektorji.

Prirojena sposobnost okužbe teh faz M13 je dobra kvalifikacija za uporabo kot vektor pri kloniranju genov. Pri razvijanju M13 v vektor je treba v njegov genom vgraditi več elementov. So gen za protein lac repressor (lac I), operacijsko proksimalno območje lac Z gen, lacni promotor in večkratno kloniranje (polilinker). Kadar se dsDNA M13 uporablja kot vektorji, jo lahko obravnavamo kot plazmidni vektor. Vendar ima uporaba ssDNA M13 prednosti pri sekvenciranju DNK in mutagenezi, usmerjeni na mesto.

Ker faktor vektor M13 nosi večkratno mesto kloniranja v lacZ regijo lahko rekombinirane vektorje zlahka prepoznamo s presejanjem modro / bele kolonije na agar ploščah, ki vsebujejo IPTG in X-Gal. Modre plošče, ki nastanejo na ploščah, ne vsebujejo rekombiniranih fagov. Zato lahko za namene kloniranja izberemo fage z vložki.

Slika 02: Bakteriofag M13

Kakšna je razlika med YAC in M13 Phage Vector?

YAC v primerjavi z faktorjem M13
YAC je gensko inženirni kromosom, ki lahko prenaša velik del tuje DNK in se razmnožuje v celicah kvasovk..	Fazni vektor M13 je virusni vektor, ki ga je razvil bakteriofag M13 in se uporablja za vstavljanje tuje DNK v E Coli.
Namen
YAC-ji so bili zasnovani za kloniranje velikih fragmentov genomske DNK v kvas.	Za vstavitev tuje DNK se uporabljajo fazni vektorji M13 E Coli.
Vstavite dolžino
YAC-ji lahko vsebujejo genske vložke v velikosti megabaze (1000 kb - 2000 kb).	Velikost vstavkov je približno 1.500 b / s.
Gradnja
YAC DNA je težko očistiti nedotaknjeno in zahteva visoko koncentracijo za ustvarjanje vektorskih sistemov YAC.	Pojavi se prek ciklične fotosintetske verige elektronov.
Stabilnost
YAC je nestabilen.	M13 fage je mogoče enostavno ekstrahirati.
Velikost
Encimi so večje molekule.	M13 fagi so stabilni kot YAC.

Povzetek - YAC proti M13 Phage Vector

YAC je umetno zgrajen vektorski sistem, ki uporablja določeno območje kromosoma kvasovk, da v celice kvasa vstavi velike segmente genskega materiala. Fazni vektor M13 je vektorski sistem, ki izhaja iz bakteriofaga M 13, ki ga uporablja E coli kot organizem gostitelj. To je glavna razlika med YAC in M13 Phage Vector. Obe sta enako uporabni pri rekombinantni tehnologiji DNK in kloniranju genov.

Referenca:
1. "Vektor." Opombe genetike - vektor. N.p., n.d. Splet. 16. maj 2017. https://genetics-notes.wikispaces.com/Vector
2. "Kvasni umetni kromosom." Wikipedija. Wikimedia Foundation, 21. april 2017. Splet. 16. maj 2017. .

Vljudnost slik:
1. "M13B" avtorja J3D3 - Lastno delo (CC BY-SA 3.0) prek Commons Wikimedia