Razlika med YAC in BAC vektorji

Ključna razlika - YAC proti BAC vektorjem
 

Vektorji se uporabljajo pri molekularnem kloniranju. Vektor je mogoče opredeliti kot molekulo DNK, ki deluje kot nosilec tujega genskega materiala v drugo celico. Vektor, ki vsebuje tujo DNK, je znan kot rekombinantna DNK, ki bi moral biti zmožen podvajanja in izražanja znotraj organizma gostitelja. Umetni kromosom kvasa (YAC) in umetni kromosom bakterij (BAC) sta dve vrsti vektorjev, ki sodelujejo pri kloniranju. Ključna razlika med YAC in BAC je v tem YAC je umetno zgrajen vektorski sistem, ki uporablja določeno območje kromosoma kvasovk, da v celice kvasa vstavi velike segmente genskega materiala medtem BAC je umetno zgrajen vektorski sistem, ki uporablja določeno območje E. coli kromosom za vstavitev velikih segmentov DNK v E. coli celice.

VSEBINA
1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj so vektorji YAC
3. Kaj so BAC vektorji
4. Vzporedna primerjava - YAC proti BAC vektorjem
5. Povzetek

Kaj so vektorji YAC?

YAC (Kvasni umetni kromosom) je umetno zgrajen kromosom, ki lahko prenaša velik del tuje DNK in se razmnožuje v celicah kvasovk. Ima centromere, telomere kot tudi avtonomno replicirajoče sekvence, ki so bistvene za razmnoževanje in stabilnost. YAC mora imeti tudi selektivni marker ali markerje in mesta omejevanja, da postane učinkovit vektor kloniranja. Veliko zaporedje, ki sega od 1000 kb do 2000 kb, se lahko vstavi v YAC in prenese v kvas. Učinkovitost transformacije YAC je zelo nizka.

Slika 01: Vektor YAC

Kaj so BAC vektorji?

Bakterijski umetni kromosom (BAC) je umetno zgrajen kromosom za molekularno kloniranje. Ima posebne regije v E. coli F plazmid in je okrogel in super zavit. BAC je razvit za kloniranje delcev DNK bakterijam, zlasti do E. coli. Lahko nosi fragmente DNK z velikostjo do 300 kb. V primerjavi z YAC so vložki za kloniranje BAC manjši po velikosti. BAC so razvili leta 1992 in je še vedno priljubljen zaradi svoje stabilnosti in enostavnosti gradnje. BAC so koristni tudi pri razvoju cepiv.

Slika 02: BAC vektor v molekularnem kloniranju

Kakšna je razlika med vektorji YAC in BAC?

YAC proti BAC Vektorji
YAC je gensko inženirni kromosom z uporabo DNK kvasovk za kloniranje.	BAC je z uporabo gensko zasnovane molekule DNA E. coli DNK zaradi kloniranja.
Spol
YAC-ji so bili zasnovani za kloniranje velikih fragmentov genomske DNK v kvas.	BAC so bili razviti za kloniranje velikih genskih fragmentov v Escherichia coli.
Vstavite dolžino
YAC lahko vsebujejo genske vložke v velikosti megabaze (1000 kb - 2000 kb).	BAC lahko nosijo vstavke 200-300 kb ali manj.
Gradnja
YAC DNK je težko očistiti nedotaknjenega in zahteva visoko koncentracijo za ustvarjanje vektorskega sistema YAC.	BAC je enostaven za čiščenje nedotaknjen in ga je mogoče enostavno sestaviti.
Himerizem
YAC-ji so pogosto himerni.	BAC so redko himerni.
Stabilnost
YAC je nestabilen.	BAC je stabilen.
Spremembe
Rekombinacija kvasovk je zelo izvedljiva in vedno ostane aktivna. Zato lahko ustvari brisanje in druge preureditve v YAC.	E. coli rekombinacija je preprečena in se po potrebi vklopi. Zato zmanjšuje neželene preureditve v BAC-jih.
Vzdrževanje
Za manipuliranje rekombinantnih YAC-ov je običajno potreben prenos YAC-a E. coli za kasnejše manipulacije. Torej gre za naporen proces.	Sprememba BAC se zgodi neposredno v E. coli. Torej ni potrebe po prenosu DNK. Zato postopek ni naporen.

Povzetek - YAC proti BAC Vektorji

YAC je zaradi svoje sposobnosti kloniranja velikih fragmentov DNK v gostiteljski organizem postalo bistveno raziskovalno orodje pri postopkih kloniranja. Vendar imajo YAC-ovi kot vektorji številne težave, kot so gradbene težave, himernost, nestabilnost itd. Zaradi tega so znanstveniki razvili BAC vektorje. BAC je bil zgrajen z uporabo določenih regij v E. coli kromosom. Je stabilen vektor in ga je enostavno zgraditi. Vendar je dolžina DNK, s katero lahko deluje BAC, tudi do 20-krat manjša od dolžine YAC. To je razlika med vektorskimi sistemi YAC in BAC. Danes je BAC bolj prednost pred YAC v laboratorijih.

Reference
1. Shero, J. H., M. K. McCormick, S. E. Antonarakis in P. Hieter. "Vektorski kromosomski vektorji za kvasovke za učinkovito manipulacijo in kartiranje s kloni." Genomics.U.S Nacionalna medicinska knjižnica, junij 1991. Splet. 25. mar. 2017
2. Ramsay, M. „Kloniranje umetnega kromosoma s kvasovkami.“ Molekularna biotehnologija. Ameriška nacionalna medicinska knjižnica, apr. 1994. Splet. 25. mar. 2017

Vljudnost slik:
1. "BAC-ji klonirajo vektorje Chem114A" avtorja Tinastella - (CC BY-SA 3.0) prek Commons Wikimedia