Razlika med zgornjo in spodnjo DNK

Ključna razlika - navzgor proti DNK navzdol
 

Pomembno je splošno poznavanje sestave in strukture DNK, da bi razumeli razliko med zgornjo in spodnjo DNK. DNK je sestavljen iz polinukleotidnih verig. Nukleotidi so gradniki, ki ustvarjajo polinukleotidne verige in vsak nukleotid je izdelan iz treh komponent: pet-ogljikovega sladkorja, dušikove baze in fosfatne skupine. Fosfatna skupina in OH skupina sta vezani na 5 'ogljik s položajem in 3' ogljikov položaj molekule sladkorja v nukleotidu. Nukleotidi so združeni s fosfodiesterskimi vezmi, tvorjenimi med 5 'fosfatno skupino enega nukleotida in 3' OH skupino sosednjega nukleotida. Če ima polinukleotidna veriga prosto 5 'fosfatno skupino, se ji dodeli 5-konec; če ima prosto 3 'OH skupino, je dodeljen kot 3' konec. Zato imajo verige DNK običajno 5 'in 3' konce glede na končne položaje polinukleotidnih verig. DNK obstaja tudi v obliki dvojne verige. Dva pramena sta med seboj paraparalna. Zato ima DNK dva sklopa, ki tečeta v smeri 5 'do 3' in 3 'do 5'. Navodno in navzdol DNA se sklicuje na transkripcijo in sintezo 5 'do 3' mRNA verige. Če se DNK šteje proti 5 koncu kodirajočega niza z mesta iniciacije transkripcije, je znana kot DNA navzgor. Če se DNK šteje proti 3 'koncu iz kodirajočega niza iz mesta iniciacije transkripcije, je znano kot DNA navzdol. To je ključna razlika med zgornjo in spodnjo DNK.

VSEBINA
1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je DNA navzgor
3. Kaj je DNA navzdol
4. Primerjava ob strani - DNK navzgor proti toku
5. Povzetek

Kaj je gorvodna DNK?

Gen je strukturna in funkcionalna enota dednosti, ki se nahaja na DNA organizma. Shranjena je z navodili za gradnjo beljakovin. Gen ima specifično regijo molekule DNA. Po potrebi prepisuje in prevaja v protein s sintezo mRNA pramena. Običajno kodirni niz gena poteka od 5 'do 3' smeri. Ko je prepisan, ustvari niz mRNA v isti smeri 5 'do 3'. Med transkripcijo 3-do 5 'antisenska nit se uporablja kot predloga predloge in sproži sintezo mRNA. V genu je mesto iniciacije transkripcije. Glede na mesto iniciacije transkripcije je območje DNA proti 5 'koncu kodirnega niza znano kot gorvodna DNK. Promotor gena se običajno nahaja v zgornjem toku DNK. V evkariontskih genih obstajajo škatle TATA, promotorski proksimalni elementi in ojačevalci na območju pred tokom gena. Navodno območje gena je označeno z negativnimi številkami. Pred transkripcijo je izjemnega pomena DNA gena izrednega pomena.

Kaj je DNA navzdol?

Mesto iniciacije transkripcije je znano kot +1 točka gena. Področje DNK od točke +1 proti 3 'koncu kodirnega niza je znano kot DNA navzdol. Povedano drugače, nizvodno od gena je od mesta iniciacije transkripcije proti 5 'koncu predloge predloge. Zato nizvodna DNK genskega območja vključuje transkripcijsko enoto in druge sekvence, kot je terminatorsko zaporedje. Promotor lahko vpliva na zaporedno zaporedje gena. Spodnji del gena se nanaša na pozitivne številke. Dolvodno DNK gena je dejansko območje, ki daje beljakovinski produkt.

Slika 01: DNA navzgor in navzdol

Kakšna je razlika med zgornjo in spodnjo DNK?

Upstream vs Downstream DNA
Področje DNA proti 5 'koncu kodirne sekvence z mesta iniciacije transkripcije je znano kot DNA navzgor.	Področje DNK proti 3 'koncu kodirnega niza iz mesta iniciacije transkripcije je znano kot DNA navzdol.
Elementi
Promotorji in ojačevalci so nameščeni na DNA navzgor	Transkripcijska enota in terminatorske sekvence se nahajajo v spodnji DNK.
Številčenje
Nukleotidi v zgornjem toku so označeni z negativnimi številkami	Nukleotidi se nanašajo na pozitivne številke.
Funkcija
Ta regija vsebuje elemente, potrebne za uravnavanje in začetek prepisa	Ta regija vsebuje navodila za proizvodnjo beljakovin in prekinitev prepisovanja

Povzetek - DNA navzgor proti toku

Lahko je prepoznati pramen RNA navzgor in navzdol. Glede na referenčno mesto je regija proti 5 'koncu niti RNA znana kot zgornja RNA, medtem ko je regija proti koncu 3' znana kot RNA navzdol. Vendar pa v DNK obstajata dva sklopa, ki tečeta v obe smeri 5 'do 3' in 3 'do 5'. Razlika med DNA navzgor in navzdol je zapletena. Zato se razlikuje glede na prepis gena. Od mesta iniciacije transkripcije proti 5 koncu čutilnega niza je območje DNA znano kot predvodna DNK, medtem ko je od mesta iniciacije transkripcije proti 3 'koncu smiselnega niza znano kot DNA navzdol. To je razlika med DNK navzgor in navzdol.

Reference:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi in Jonatha M. Gott. "Ločene vloge za zaporedja pred in navzdol od strani Physarumediting." RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, september 2009. Splet. 18. marec 2017

Vljudnost slik:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro in Luísa Romão. "Uredba o izražanju genov z odprtimi okviri za branje in človeškimi boleznimi." PLOS Genetika. Javna knjižnica znanosti, n.d. Splet. 18. marec 2017.