Razlika med RNASE A in RNASE H

Ključna razlika - RNASE A proti RNASE H
 

Ribonukleze so nukleaze, ki RNA posebej razgradijo na manjše enote. Lahko jih razdelimo v dve kategoriji; endoribonukleaze in eksoribonukleaze. Endoribonukleaza je endonukleaza, ki lahko razgradi enojno ali dvoverižno RNA. Cepi fosfodiesterske vezi v polnukleotidni verigi RNA. Primeri so RNaza A, RNaza III, RNaza T1, RNaza P in RNaza H. Exoribonuclease je eksonukleaza, ki je razgradila RNA z odstranjevanjem končnih nukleotidov bodisi iz 5'-konca bodisi 3'-konca molekule RNA. Primeri so RNaza R, RNaza II, RNaza D in RNaza PH. The ključna razlika med RNASE A in RNASE H je, da je RNase A je ribonukleaza trebušne slinavke, ki posebej razgradi enojno RNA na manjše komponente, medtem ko je RNase H nespecifičen encim, ki cepi RNA v hibridu RNA-DNA na manjše enote s pomočjo hidroliznega mehanizma.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je RNASE A
3. Kaj je RNASE H
4. Podobnosti med RNASE A in RNASE H
5. Primerjava ob strani - RNASE A proti RNASE H v tabeli
6. Povzetek

Kaj je RNASE A?

RNaza A je ribonukleaza trebušne slinavke, ki posebno odcepi ostanke citozina in uracila na 3 'koncu enojne RNA. RNase H deluje pri višji koncentraciji soli (0,3 M ali višja koncentracija NaCl). Hidrolitična reakcija je dva koraka. Z 2 ', 3' cikličnim monofosfatnim vmesnikom tvori 3 'fosforiliran produkt. Čeprav je specifična za enoverižno RNA pri višji koncentraciji soli, lahko razgradi tudi dvoverižno RNA in RNA v hibridu RNA-DNA pri nižji koncentraciji NaCl (nižji od 0,3 M NaCl).

Bruce Merrifield je prvi sintetiziral ta encim. RNaza A je zelo priljubljen encim v molekularnih raziskavah. Goveja trebušna slinavka RNaza A je primer RNaze A. In je eden najtežjih encimov, ki se uporabljajo v laboratoriju. Ta encim za svojo aktivnost ne potrebuje kofaktorja. Je zelo termostabilen encim. RNaza A je prvi encim in tretji protein, pri katerem je bilo zaznano pravilno zaporedje aminokislin. Ta encim je s 124 aminokislinami in molekularno maso 12600da zelo majhen. In ima štiri histidinske ostanke (njegovih 12 in njegovih 119, ki sodelujejo v katalitični reakciji).

Slika 01: RNaza A

RNazo A lahko izoliramo z vrenjem surovega vzorca. Ko zavre, vsi drugi encimi razgradijo preostalo RNazo A. RNaza A je neverjetno stabilen encim. Ta encim zavira z zaviralci ribonukleaze, težkimi kovinami in uridin vanadata.

Kaj je RNaza H?

RNaza H je nespecifičen encim ribonukleaze, ki lahko razgradi RNA v hibridu RNA-DNA s hidrolizno reakcijo. RNaza H cepi 3'-O-P RNA v hibridu RNA-DNA. Končno proizvaja 3'OH in 5 'fosfatne izdelke, ki se končajo. Pri podvajanju DNK igra osrednjo vlogo, saj odstranjuje temeljni premaz RNA, potem ko se oblikujejo novi prameni DNK. V laboratorijskih razmerah ta specifično razgradi RNA v hibridu RNA-DNA, ne pa v DNK in nehibridizirani RNA. In ta encim se običajno uporablja za uničenje predloge RNA, potem ko se med sintezo cDNA oblikuje prvi komplementarni niz DNK.

Slika 02: RNaza H

RNase H uporablja tudi pri testu za zaščito pred nukleusi. Vključi se lahko tudi v odstranitev repa A iz mRNA. RNase H ima sposobnost uničevanja nekodirajoče RNA znotraj in zunaj celice. Kovinski ioni so za to beljakovinsko aktivnost potrebni kot kofaktorji. Za zaviranje encima RNase H lahko uporabimo helator (EDTA).

Kakšne so podobnosti med RNASE A in RNASE H?

• Oboje je beljakovinske narave.
• Oba sta endoribonukleaza
• Oboje lahko razgradi RNA.
• Oba izvajata hidrolizne reakcije.
• Molekularni laboratoriji uporabljajo oboje.

Kakšna je razlika med RNASE A in RNASE H?

RNASE A proti RNASE H
RNaza A je ribonukleaza trebušne slinavke, ki posebej odcepi 3 'konce neparenih ostankov citozina in uracila enojne verige RNA pri višji koncentraciji soli.	RNase H je nespecifičen encim ribonukleaza, ki lahko razgradi RNA v hibridu RNA-DNA s hidrolizno reakcijo.
Narava cepitve RNK
RNase A posebej cepi enojno RNA pri višji koncentraciji soli.	RNaza H cepi RNA v hibridu RNA-DNA.
Potreba ko-dejavnikov za dejavnost
RNase A za svojo aktivnost ne potrebuje kofaktorjev.	RNase H potrebuje kovinske ione kot kofaktorje za svojo aktivnost.
Zaviralci aktivnosti beljakovin
Proteini inhibitorja ribonukleaze, težkih kovin in uridin vanadata zavirajo aktivnost RNAze A.	Kelator (EDTA) zavira aktivnost RNase H.
Odstranjevanje primerja RNA v podvajanju DNK
RNaza A se ne uporablja za odstranjevanje prajmera RNA pri podvajanju DNK.	RNase H se uporablja za odstranjevanje temeljnih snovi RNA pri podvajanju DNK
Odstranitev predloge DNK v komplementarni sintezi DNK (C-DNA)
RNaza A se ne uporablja za odstranjevanje šablon RNA med komplementarno sintezo DNA (C-DNA).	RNaza H se uporablja za odstranjevanje šablon RNA med komplementarno sintezo DNK (C-DNA).
Odstranitev poli-A-repa v mRNA hibridizirana na Oligo (dt)
RNase A se ne uporablja za odstranjevanje "poly-A repa" v mRNA, hibridizirane na oligo (dt).	RNase H se uporablja za odstranjevanje "poly-A repa" v mRNA, hibridizirane na oligo (dt)

Povzetek - RNASE A proti RNASE H

Ribonukleze so encimi nukleaze, ki imajo sposobnost cepitve RNK na manjše enote. So dve vrsti; endoribonukleaze in eksoribonukleaze. Endoribonukleaza je endonukleaza, ki ima sposobnost razgradnje enoverižne ali dvoverižne RNA. In cepi fosfodiestersko vez v polnukleotidni verigi RNA. RNaza A in RNaza H sta dve endoribonuklezi. RNaza A je ribonukleaza trebušne slinavke, ki posebej razcepi ostanke citozina in uracila na 3 'koncu enojne RNA pri višji koncentraciji soli. RNaza H je nespecifičen encim ribonukleaze, ki lahko razgradi RNA v hibridu RNA-DNA s hidrolizno reakcijo. To je razlika med RNazo A in RNazo H.

Prenesite PDF RNASE A proti RNASE H

Lahko prenesete PDF različico tega članka in jo uporabljate za namene brez povezave, kot je navedeno v navodilu. Prosimo, prenesite PDF različico tukaj Razlika med RNASE A in RNASE H

Referenca:

1.Karuturi, Avtor Amrutha. "17 morate vedeti dejstva o RNase A." AG Blog, 22. februar 2017. Na voljo tukaj
2. "Ribonuklease." Wikipedia, fundacija Wikimedia, 5. januarja 2018. Na voljo tukaj  

Vljudnost slik:

1.'RNase A'By Avtor ni na voljo za branje avtorja. Vossman je prevzel (na podlagi trditev o avtorskih pravicah). (CC BY-SA 2.5) prek Wikimedije Commons
2.'RNase H fix'By Avtor ni naveden strojno berljivega avtorja. Vossman je prevzel (na podlagi trditev o avtorskih pravicah). (CC BY-SA 2.5) prek Wikimedije Commons