Razlika med ponudnikom in operaterjem

Ključna razlika - predlagatelj vs operater
 

Zaporedja DNA, ki niso kodirna regija gena, so ključnega pomena pri opravljanju različnih funkcij v zvezi s postopkom prepisovanja. Transkripcija je encimsko kataliziran postopek, ki prekriva ali pretvarja verigo DNK v njen podoben niz mRNA. V osrednji dogmi življenja je transkripcija DNK v mRNA prva faza sinteze beljakovin. Sledi prevajanje, ki pretvori zaporedje mRNA v aminokislinsko zaporedje, ki naredi pričakovani protein. Med različnimi sekvencami, ki jih najdemo v organizmih, pri transkripciji igrajo glavno vlogo promotorske sekvence in operacijske sekvence. Promotorji so prisotni tako v prokariotih kot v evkariotih. Postavljeni so pred začetnim mestom transkripcije in so mesta, na katera se veže encim RNA polimeraza. Operaterji so prisotni le v prokariotih. So mesta, na katerih se regulacijska molekula veže na operon. The ključna razlika med promotorjem in operaterjem temelji na vrsti molekule, ki se veže na ustrezno zaporedje DNK. RNA polimeraza se veže na promotor, medtem ko se regulacijske molekule operonskega sistema vežejo na operaterja.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je predlagatelj
3. Kaj je operater
4. Podobnosti med ponudnikom in operaterjem
5. Primerjava ob strani - Promotor proti operaterju v tabeli
6. Povzetek

Kaj je promotor?

Promotor je zaporedje DNK, postavljeno pred začetno stran transkripcije. To pomembno zaporedje DNK najdemo tako v evkariotih kot v prokariotih; čeprav se eukariotski promotorji lahko razlikujejo od prokariotskih promotorjev. Promotorji so regije DNA, na katere se med postopkom prepisovanja veže RNA polimeraza. Je glavni encim, ki sodeluje pri ustvarjanju enoverižne RNA (mRNA, tRNA, rRNA) iz predloge DNK. Polimeraza RNA se bo razlikovala od vrste RNA. Promotorne sekvence so zelo ohranjene regije v celotnem genomu. Zato so znane kot regije soglasja. Mehanizem delovanja promotorja se pri evkariotih in prokariotih razlikuje.

V evkariotih je ohranjeno zaporedje, ki ga najdemo v promotorjih, imenovano kot polje TATA, ki se nahaja na položaju -10 gena. Vezavo RNA polimeraze na polje TATA olajšujejo faktorji vezave transkripcije. Ti transkripcijski faktorji naredijo potrditvene spremembe v promotorskem zaporedju in povečajo njegovo afiniteto za vezavo RNA polimeraze. Tako je prediniciacijski kompleks, ki nastane med iniciacijo transkripcije, sestavljen iz kompleksa, ki je tvorjen s 7 transkripcijskimi faktorji in promocijskim mestom. Ko se ta kompleks oblikuje, se evkariontska RNA polimeraza zlahka veže na promotor in začne s prepisovanjem.

Slika 01: Promotor

Pri prokariotih je mehanizem veliko enostavnejši, saj ne vsebujejo nobenih faktorjev transkripcije. Namesto tega sigma faktor RNA polimeraze sodeluje pri prepoznavanju promotorja in pri sestavljanju encima na promotorju. V prokariotih obstajata dve glavni ohranjeni promocijski regiji, ustrezno promocijsko zaporedje v polju TATA je znano kot "Pribnow Box". Škatla Pribnow (položaj -10) je sestavljena iz zaporedja TATAAT. Drugo zaporedje promotorjev je znano kot element -35, saj se nahaja na položaju -35.

Kaj je operater?

V strukturi prokariotskih genov najdemo operaterja. Je glavno območje DNK, na katero se vežejo regulacijske molekule operonskega sistema. Operator laka je operacijsko zaporedje, ki je prisotno v lacnem operonu številnih prokariotskih bakterij. V primeru lakovega operona se molekula represorja veže na območje operaterja. Ta vezava bo RNA polimerazi preprečila prepisovanje genov navzdol od operaterja.

Slika 02: Upravljavec Operona

Eukarioti nimajo regij operaterjev. Namesto tega se njihovi transkripcijski faktorji, ki sodelujejo pri uravnavanju prepisovanja, vežejo na promocijske regije. Tako je glavna funkcija operaterja v prokariotih uravnavanje izražanja genov.

Kakšne so podobnosti med promotorjem in operaterjem?

• Tako promotor kot operater sta sestavljena iz nukleinskih kislin deoksiriboze (DNK).
• Tako postopki promotorja kot operaterja sta pomembni pri postopku prepisovanja.

Kakšna je razlika med promotorjem in operaterjem?

Promotor proti operaterju
Promotorji so mesta, na katera se veže polimeraza RNA in so prisotne pred začetnim mestom transkripcije gena.	Operaterji so mesta, na katerih se regulacijska molekula veže na model operona.
Vrsta organizma
Promotorje najdemo tako v prokariotih kot v evkariotih.	Operaterje najdemo le v prokariotih.
Funkcija
Promotor olajša vezavo RNA polimeraze in transkripcijskih faktorjev (samo v evkariotih) na gen za transkripcijo genov. V prokariotih promocijsko območje olajša vezavo sigma faktorja RNA polimeraze (v prokariotih).	Operaterji uravnavajo ekspresijo genov tako, da olajšajo vezavo regulacijske molekule na operon.

Povzetek - Promotor vs operater

Promotor in operater sta pomembni sekvenci DNK, ki sta vključeni v postopek prepisa in v regulacijo transkripcije. Promocijske sekvence najdemo tako v prokariotih kot v evkariotu. Promotor je mesto za vezavo RNA polimeraze. Gre za zelo ohranjene regije, znane kot soglasne sekvence. Običajni promotorji sta polje TATA evkariotov in polje Pribnow in promotor prokariotov -35. Operaterji so prisotni le v prokariotih, kjer nadzorujejo ekspresijo genov tako, da vežejo represor in zavirajo transkripcijo genov navzdol (vodno) (koncept lac operon) ali se vežejo na aktivator in inducirajo transkripcijo (trp operon koncept). To je razlika med promotorjem in operaterjem.

Referenca:

1. "Dejavnost BioCoach." Pearson - Mesto biologije, ki je na voljo tukaj 
2. "Promotorji." Addgene, na voljo tukaj  

Vljudnost slik:

1. 'Slika 16 02 02' CNX OpenStax, (CC BY 4.0) prek Commons Wikimedia
2.'Lac-operon'By Barbarossa na nizozemski Wikipediji, (CC BY-SA 3.0) prek Commons Wikimedia