Organizmi imajo kromosomsko DNK in ekstrahromosomsko DNK. Kromosomska DNK je glavni del genetskega materiala, ki vsebuje podatke o dednosti. Ekstrahromosomska DNK je pomembna tudi za organizme; pri prokariotih ima ekstrahromosomska DNK posebne gene, kot so odpornost na antibiotike, odpornost na različne težke kovine in razgradnjo makromolekule. Plazmid in epizom sta dve vrsti ekstrahromosomske DNK organizmov. Plazmidi so zaprta, okrogla in dvoverižna DNK bakterij. Episom je druga vrsta sorazmerno večje ekstrahromosomske DNK, ki jo posedujejo organizmi. Ključna razlika med plazmidom in epizomom je v tem plazmidi se ne morejo integrirati z bakterijsko kromosomsko DNK medtem epizomi se lahko integrirajo s kromosomsko DNK.
VSEBINA
1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je plazmid
3. Kaj je epizoda
4. Primerjava ob strani - Plasmid proti Episomu
5. Povzetek
Plazmid je majhna okrogla dvojno verižna DNK. Bakterije vsebujejo plazmide kot njihov dodatni kromosomski material. Plazmidi so sposobni samo-razmnoževanja, ne da bi se povezali s kromosomi. Imajo gene ali informacije, ki so potrebne za njegovo razmnoževanje in vzdrževanje. Zato jih obravnavamo kot neodvisno DNK.
Plazmidi so zelo majhni. Obstajajo kot zaprti krogi znotraj bakterije. Plazmidi vsebujejo bistvene gene bakterij. Ti geni kodirajo posebne lastnosti, ki so koristne za bakterije, kot so odpornost proti antibiotikom, razgradnja makromolekule, toleranca na težke kovine in proizvodnja bakteriocinov.
Plazmidi imajo v molekularni biologiji ogromno uporabo kot vektorji. Dvojna narava DNK, geni za odpornost na antibiotike, sposobnost samo-razmnoževanja in posebna mesta restrikcije so pomembne lastnosti, zaradi katerih so plazmidi bolj primerni kot vektorske molekule v tehnologiji rekombinantne DNA. Plazmide je tudi enostavno izolirati in spremeniti v gostiteljske bakterije.
Slika 01: Plazmidi
Episom je ekstrahromosomski del genskega materiala, ki lahko nekaj časa obstaja kot neodvisna DNK in integrirana oblika v genomski DNK organizma. Epizomi veljajo za nebistvene genetske elemente. Večinoma izvirajo zunaj gostitelja v virusu ali v drugi bakteriji. Lahko vstopijo v gostiteljski organizem in obstajajo kot ekstrahromosomska DNK ter se kasneje integrirajo z genomsko DNK in se razmnožijo. Če obstajajo kot neintegrirane enote, jih gostiteljska celica lahko uniči. Če bodo integrirane, bodo nove kopije epizod nastale in posredovane tudi v hčerinske celice.
Epizome lahko razlikujemo od plazmidov zaradi večje velikosti. Nekaj primerov vključuje zaporedje vstavitve, faktor F bakterij in nekatere viruse.
Slika 02: Epizomi
Plasmid vs Episome | |
Plazmid je majhna, okrogla, dvoverižna ekstrahromosomska molekula DNK. | Episom je nekakšna ekstrahromosomska DNK, ki je večja od plazmidov. |
Sposobnost samo ponovitve | |
Vsebuje potrebne podatke za samoprevajanje. | Ne vsebuje informacij za samoprevajanje. |
Povezava s kromosomsko DNK | |
Ne morejo se povezati s kromosomsko DNK bakterij. | Lahko se integrirajo s kromosomsko DNK. |
Posebno kodiranje genov | |
Nekateri geni, ki se nahajajo v plazmidih, dajejo bakterijam posebne lastnosti, kot so odpornost na antibiotike, toleranco na težke kovine itd. | Epizomi ne vsebujejo posebnih genov. F plazmid vsebuje samo F faktorsko DNK. |
Uporabite kot Vektorji | |
Plazmidi se uporabljajo kot vektorji. | Epizomi se ne uporabljajo kot vektorji. |
Episom in plazmid služita kot ekstrahromosomska DNK bakterij. Plazmidi so samopomnožujoče majhne krožne molekule DNA, ki imajo posebne lastnosti, kot so odpornost na antibiotike itd. Plazmidi se uporabljajo kot vektorji v tehnologiji rekombinantne DNA. Plazmidi se ne morejo integrirati v bakterijski kromosom. Episom je še ena vrsta ekstrahromosomske DNK bakterij. Lahko se integrirajo v bakterijske kromosome in med replikacijo prehajajo v hčerinske celice. Večji so od plazmidov, ki vsebujejo več baznih parov. To je razlika med plazmidi in epizomi.
Reference:
1. Abbas, Wasim. "Epizodi." Članki o DNK, kromosomih, genetiki in gostitelju - JRank. N.p., n.d. Splet. 08. april 2017
2. Couturier, M., F. Bex, P. L. Bergquist in W. K. Maas. "Identifikacija in klasifikacija bakterijskih plazmidov." Mikrobiološki pregledi. Ameriška nacionalna medicinska knjižnica, september 1988. Splet. 08. april 2017
3. Bennett, P. M. "Plazmid kodiran odpornost na antibiotike: pridobivanje in prenos genov za odpornost na antibiotike v bakterijah." British Journal of Pharmacology. Nature Publishing Group, marec 2008. Splet. 08. april 2017