Razlika med plazmidom in kozmidom

The ključna razlika med plazmidom in kozmidom je to plazmid je dvoverižna, krožna in zaprta ekstrahromosomska DNK, prisotna v bakterijah in arhejah, medtem ko je kosmid hibridni vektorski sistem, ki nastane zaradi združevanja cos zaporedje lambda faga in plazmidne DNA bakterij.

Gensko inženirstvo je napredna študija Biotehnologije. Tehnika genskega inženiringa lahko spremeni ali spremeni genom živih organizmov. Poleg tega je gensko inženiring koristno pri genskem zdravljenju in zdravljenju genetskih motenj. Pred vstavitvijo genov v genom drugega organizma je potrebno narediti rekombinantno molekulo DNA, ki lahko nosi želeni fragment DNK in se dostavi v gostiteljski organizem. Zato med rekombinantno tehnologijo DNA to izvaja vektorski sistem. Torej, vektor deluje kot nosilec ali posrednik med darovalcem in gostiteljskim organizmom. Plazmid in kozmid sta dve vrsti vektorjev, ki se običajno uporabljata v tehnologiji rekombinantne DNA in genskem inženiringu. Nekateri so naravni, drugi pa umetni. Plazmid je naravni vektor, kozmid pa umetno zgrajen vektor. Obe vrsti imata prednosti in slabosti.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je plazmid
3. Kaj je Cosmid
4. Podobnosti med plazmidom in kozmidom
5. Primerjava ob strani - plazmid proti kozmidu v tabeli
6. Povzetek

Kaj je plazmid?

Plazmid je majhen, okrogel, dvoveren DNK, ki je prisoten v prokariotskih organizmih predvsem v bakterijah in arhejah. Obstajajo kot zaprti krogi znotraj bakterije. Prav tako plazmidi niso genomska DNK. Zato prisotnost ali odsotnost plazmidov v prokariotskih celicah ne vpliva na preživetje teh celic. Plazmidi so ekstrahromosomska DNK. Vendar plazmidi zagotavljajo dodatne prednosti bakterijam in arhejam. Vsebujejo posebne gene, kot so odpornost na antibiotike, odpornost na različne težke kovine, propadanje makromolekule itd.

Poleg tega so plazmidi sposobni samo-razmnoževanja, ne da bi se povezali s kromosomi. Nosi gene ali informacije, ki so potrebne za lastno razmnoževanje in vzdrževanje. Poleg tega so neodvisni DNK. Zaradi teh posebnosti imajo plazmidi v molekularni biologiji ogromno uporabo kot vektorji.

Slika 01: Plazmidi

Dvojne verige DNA, geni za odpornost na antibiotike, sposobnost samo-razmnoževanja in posebna mesta restrikcije so pomembne značilnosti, zaradi katerih so plazmidi bolj primerni kot vektorske molekule v tehnologiji rekombinantne DNA. In tudi plazmide enostavno izoliramo in pretvorimo v gostiteljske bakterije.

Kaj je Cosmid?

Cosmid je hibridni vektorski sistem. Je umetni vektor, zgrajen s kombinacijo cos sekvence Lambda fago delcev in plazmida. Te cos mesta ali sekvence so dolgi fragmenti DNK, ki jih sestavlja 200 baznih parov. Imajo kohezivne ali lepljive konce, ki omogočajo, da se plazmid prilepi v virusno DNK. Zato so cos mesta ključnega pomena za pakiranje DNK. Obstajajo tri cos mesta, in sicer cosN mesto, cosB mesto in cosQ mesto. Ta mesta vključujejo nikiranje verige DNA z aktivnostjo terminaze, zadrževanje terminaze in preprečevanje razgradnje DNK z DNazami.

Slika 02: Cosmid

Kozmidi lahko bodisi posnemajo enoverižno DNK ali dvoverižno DNK z uporabo primernega izvora replikacije. Vsebujejo tudi gene proti antibiotični odpornosti, ki so lahko uporabni kot markerji pri izbiri transformiranih celic. Tako so tudi kozmidi, podobni plazmidom, dobri prenašalci v tehnologiji rekombinantne DNA.

Kakšne so podobnosti med plazmidom in kozmidom?

  • Plazmid in kozmid sta vektorja, ki se običajno uporabljata v tehnologiji rekombinantne DNA.
  • Oba sta sposobna samodejno ponoviti.
  • Imajo izvor podvajanja.
  • Poleg tega imajo več lokacij za kloniranje.
  • Prav tako vsebujejo gene, odporne na antibiotike, ki so uporabni kot markerji.
  • Tujo DNK lahko vstavimo v obe vrsti in naredimo rekombinantne molekule.
  • Za oba vektorja so na voljo enostavne metode presejanja.
  • Obe sta uporabni za gradnjo genskih knjižnic.

Kakšna je razlika med plazmidom in kozmidom?

Plazmid in kozmid sta dve vrsti vektorjev kloniranja, ki se uporabljata v genskem inženiringu. Plazmidi so majhne, ​​okrogle dvojne verige ekstrahromosomske molekule DNK, prisotne v bakterijah in arhejah. Na drugi strani je kozmid hibridni vektor, zgrajen iz cos sekvenc lambda fag DNA in plazmidne DNA. To je ključna razlika med plazmidom in kozmidom. Poleg tega lahko plazmidi nosijo do 25 kb fragmentov DNK, medtem ko komsidi lahko vsebujejo do 45 kb fragmente. Tako je to še ena razlika med plazmidom in kozmidom.

Več podrobnosti je podanih v infografiki o razliki med plazmidom in kozmidom.

Povzetek - Plasmid proti Cosmidu

Plazmid je naravno ekstrakromosomska DNK, medtem ko je kozmid hibridni vektor fagne DNA in plazmidne DNK. Oba sta klonirana vektorja, ki se uporabljata v rekombinantni tehnologiji DNK. Cosmidi vsebujejo posebne lepljive konce, znane kot cos mesta, ki so potrebne za in vitro embalaža. Po drugi strani plazmidi vsebujejo več lastnosti, zaradi katerih so idealni prenašalci genskega inženiringa. Oba sta lahko neodvisna podvajanja oz in vitro pakiranje na bakterijske celice. Plazmidi lahko vsebujejo tuji fragment DNK dolžine 25 kb, medtem ko kozmidi lahko vsebujejo tujkovni fragment DNK 45 kb. Zato so kozmidi koristni pri kloniranju večjih fragmentov DNK, saj plazmidni vektorji ne morejo klonirati večjih fragmentov. Tako to povzame razliko med plazmidom in kozmidom.

Referenca:

1.Nature News, Nature Publishing Group. Na voljo tukaj  
2. "Kozmid." NeuroImage, Academic Press. Na voljo tukaj  

Vljudnost slik:

1. ”Plasmid (slovensko)” od Spaully - Lastno delo, (CC BY-SA 2.5) prek Commons Wikimedia 
2. "Cosmid (angleščina)" Zlir'a (CC0) prek Commons Wikimedia