Peptid proti beljakovinam
Aminokisline, peptide in beljakovine pogosto imenujemo sorodni izrazi, vendar se razlikujejo po svojih značilnostih. Aminokisline so gradniki tako peptidov kot beljakovin. Aminokislina je majhna molekula, ki vsebuje amino skupino (-NH2) in skupino karboksilne kisline (-COOH), ki sta vezana na centralni atom ogljika, z dodatnim vodikom in stransko verigo (R- skupina). Ta stranska veriga se razlikuje med vsemi aminokislinami; zato določa edinstvene lastnosti in kemijo vsake aminokisline. Za določitev zaporedja aminokislin v peptidih in proteinih se uporablja posebno gensko zaporedje.
Peptid
Peptidi so sestavljeni z dvema ali več aminokislinami, povezanimi s peptidnimi vezmi in so prisotni kot linearne verige. Dolžina peptida je določena s količino aminokislin v njem. Običajno je dolžina peptida manjša od približno 100 aminokislin.
Predpone se uporabljajo za opisovanje vrste peptidov v splošni terminologiji. Na primer, ko je peptid sestavljen iz dveh aminokislin, ga imenujemo dipeptid. Tako so tri aminokisline združene, da dobimo tripeptide, štiri aminokisline so združene, da dobimo tetrapeptide itd. Poleg teh vrst obstajajo oligopeptidi (sestavljeni iz 2-20 aminokislin) in polipeptidi, ki imajo veliko peptidov (manj kot 100). Najpomembnejše značilnosti peptidov določajo količina in zaporedje aminokislin.
Primarna funkcija večine peptidov je omogočiti učinkovito komunikacijo z prenašanjem biokemičnih sporočil z enega kraja na drugega v telesu.
Beljakovine
Beljakovine so najbolj raznolika skupina bioloških makromolekul. Protein je sestavljen iz ene ali več dolgih nerazvejanih verig, imenovanih polipeptidi, vendar so gradniki beljakovin aminokisline. Zaporedje aminokislin določa glavne značilnosti proteina, medtem ko je to zaporedje aminokislin določeno z določenim genskim zaporedjem.
Običajno imajo beljakovine stabilne tridimenzionalne strukture. O teh strukturah je mogoče razpravljati v smislu hierarhije štirih ravni; primarna, sekundarna, terciarna in kvartarna. Primarna struktura je aminokislinsko zaporedje proteina. Sekundarna struktura nastaja tako, da tvorita vodikove vezi med dvema aminokislinama v bližini, tako da nastanejo strukture, imenovane pločevine, prevlečene z β, in tuljave, imenovane α-vijaki. Področja sekundarne strukture se nato zložijo naprej v prostoru, da tvorijo končne tridimenzionalne strukture proteina. Razporeditev večih polipeptidov v vesolju povzroči kvartarno strukturo proteina.
Glavne funkcije beljakovin so encimska kataliza, obramba, transport, podpora, gibanje, regulacija in skladiščenje.
Kakšna je razlika med peptidom in beljakovinami?
• Peptidi so kratke linearne verige aminokislin, beljakovine pa zelo dolge verige aminokislin.
• Več aminokislin je povezanih skupaj, da tvorijo peptid s peptidnimi vezmi, medtem ko je več peptidov povezanih skupaj, da tvorijo beljakovinske molekule.
• Običajno imajo beljakovine stabilne tridimenzionalne strukture. V nasprotju s tem peptidi niso organizirani v stabilni tridimenzionalni strukturi.
• Dolžina peptida je manjša od približno 100 aminokislin, beljakovine pa več kot 100 aminokislin. (Obstajajo izjeme; zato se razlike bolj zanašajo na delovanje molekul, ne pa na njihove velikosti)
• Za razliko od peptidov beljakovine veljajo za makromolekule.
• V peptidih samo stranske verige aminokislin tvorijo vodikove vezi. Medtem ko v beljakovinah ne samo stranske verige, ampak tudi peptidne skupine tvorijo vodikove vezi. Te vodikove vezi so lahko z vodo ali z drugimi peptidnimi skupinami.
• Vsi peptidi obstajajo kot linearne verige, medtem ko lahko beljakovine obstajajo kot primarna, sekundarna, terciarna in kvaternarna.