Razlika med mini in satelitskim mikrosatelitom

Ključna razlika - Minisatellite v primerjavi z mikrosatelitom
 

Ponavljajoča se DNA so nukleotidne sekvence, ki se vedno znova in znova ponavljajo v genomu organizmov. Ponavljajoča se DNA predstavlja pomemben del genomske DNK in obstajajo tri glavne vrste, imenovane tandemske ponovitve, končne ponovitve in zmešane ponovitve. Ponavljanja v tandemu so zelo ponavljajoča sekvence, ki ležijo ena ob drugi brez prekinitve. V genomu vretenčarjev obstajajo tri glavne vrste ponovitev tandema. So satelitski DNK, mikrosatelitski DNK in minisatelinski DNK. Minisatelit je odsek zelo ponovljenih DNK, ki je sestavljen iz niza ponavljajočih se sekvenc, sestavljenih iz 10 do 100 baznih parov. Mikrosatelit je odsek ponavljajoče se DNA, ki ga sestavljajo kratka ponavljajoča sekvence, sestavljene iz 1 do 9 baznih parov. Zato je ključna razlika med minisatelitskim in mikrosatelitom velikost ali dolžina ponavljajočega se zaporedja.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je Minisatel
3. Kaj je mikrosatelit
4. Podobnosti med minisatelitom in mikrosatelitom
5. Primerjava drug ob drugem - Minisatell vs mikrosatelit v tabeli
6. Povzetek

Kaj je Minisatel?

Minisatelitska DNK je odsek DNK, ki obsega niz kratkih ponavljajočih se sekvenc DNA, ki so dolge od 10 do 60 baznih parov. Omenjeni so tudi minisateliti tandem s spremenljivo številko se ponavlja (VNTR). Minimalni sateliti so pogosto zmedeni z mikrosateliti. Vendar se minisateliti in mikrosateliti zdaj ločijo po velikosti ponavljajočega se zaporedja znanstvenikov.

Minisatelite lahko vidimo na več kot 1000 lokacijah človeškega genoma. Ta kratka zaporedja so bogata z G in C. Število ponovitev v določenem minisatelitu se med posamezniki zelo razlikuje.

Prvi človeški minisatelit sta leta 1980 identificirala A. R. Wyman in R. White. Kasneje je Alec Jeffreys odkril ekstremni polimorfizem kopije števila minisatelitov med organizmi. Ta odkritja so naredila minisatelite kot idealne označevalce za odvzem prstnih odtisov DNK, analizo povezav in populacijske študije. Tudi minisateliti prispevajo k uravnavanju genske ekspresije, prepisovanju, alternativnemu spajanju itd.

Kaj je mikrosatelit?

Mikrosatelit je odsek DNK, ki ima preproste ponovitve zaporedja, dolge od 1 do 10 baznih parov. Imenujejo se tudi mikrosateliti kratke zaporedne ponovitve (SSR) ali enostavna ponovitev v tandemu (STR).  Obstajata dve vrsti mikrosatelitov, imenovanih preprosti mikrosateliti in sestavljeni mikrosateliti. Preprosti mikrosateliti so sestavljeni iz samo ene vrste zaporedja ponavljanja. Kompozitni mikrosateliti so sestavljeni iz več vrst ponovitev. Mikrosateliti najpogosteje imajo področja A / T. Mikrosateliti so kodominantni in obilni v evkariontskih genomih.

Podobno kot minisateliti tudi mikrosateliti kažejo polimorfizem med posamezniki. Število ponovitev za določen mikrosatelit se med posamezniki razlikuje. Zato se lahko mikrosateliti uporabljajo tudi kot genetski markerji pri prstnem odtisu DNK. Mikrosatelitski polimorfizem zlahka prepoznamo s PCR in gel elektroforezo. Naslednje območje mikrosatelita je v sorodnih vrstah zelo ohranjeno.

Kakšne so podobnosti med minisatelitom in mikrosatelitom?

• Minisateliti in mikrosateliti so nekodirajoče sekvence DNK.
• Oba sta v tandemu ponavljanja.
• Obe sestavljata zelo ponavljajoča sekvence.
• Oboje lahko uporabimo kot močne genetske markerje za odvzem prstnih odtisov DNK.

Kakšna je razlika med minisatelitskim in mikrosatelitskim?

Minisatell vs Microsatellite
Minimalni sateliti so tandemske ponovitve z dolžino ponavljanja monomera od 10 do 100 baznih parov.	Mikrosateliti so kratke tandemske ponovitve, ki jih sestavljajo 1 do 9 osnovnih monomernih zaporedij baznih parov.
Velikost ponavljajočega se zaporedja
Minisatelit ima ponavljajoče sekvence od 10 do 100 baznih parov.	Mikrosatelit ima kratke sekvence od 1 do 9 baznih parov.
Skupne baze
Minisateliti so bogati z bazami G in C.	Mikrosateliti so bogati z A in T bazami.
Druga imena
Minisateliti so znani tudi kot ponovitve v tandemu s spremenljivo številko (VNTR).	Mikrosateliti so znani tudi kot ponovitve s kratkimi zaporedji (SSR) ali preproste ponovitve v tandemu (STR).

Povzetek - Minisatell vs Microsatellite

Minisatelit in mikrosatelit sta dve vrsti ponovitev v tandemu. Razlikujemo jih glede na število baz v ponavljajočem se zaporedju ali velikost zaporedja. Minisatellet ima ponavljajoče se zaporedje od 10 do 100 baznih parov, mikrosatelit pa ima zaporedje od 1 do 9 baznih parov. To je glavna razlika med minisatelitskim in mikrosatelitskim. Število kopij v ponavljajočem se nizu v minisatelitih in mikrosatelitih se med posamezniki zelo razlikuje. Tako minisateliti kot mikrosateliti so močni markerji DNK za analizo genske variacije znotraj in med populacijami vrst.

Prenesite PDF različico Minisatell vs Microsatellite

Lahko prenesete PDF različico tega članka in jo uporabljate za namene brez povezave v skladu z navedbami. Prosimo, da tukaj prenesete PDF različico. Razlika med mini in satelitskim sistemom.

Reference:

1.Haneef, Deena T Kochunni Jazir. "Glavne razlike." Razlika med mini in satelitskim mikrosatelitom. N.p., n.d. Splet. Na voljo tukaj 6. julij 2017.
2.Vieira, Maria Lucia Carneiro, Luciane Santini, Augusto Lima Diniz in Carla De Freitas Munhoz. "Mikrosatelitski markerji: kaj pomenijo in zakaj so tako uporabni." Genetika in molekularna biologija. Sociedade Brasileira de Genética, 2016. Splet. Na voljo tukaj 07. julij 2017.

Vljudnost slik:

1. "VNTRexample" Madelyndotson - Lastno delo (CC BY-SA 4.0) prek Commons Wikimedia