Antikodoni so trinukleotidne enote v transportnih RNA (tRNA), ki se dopolnjujejo kodonom v messengerskih RNA (mRNA). TRNA omogočajo, da med proizvodnjo beljakovin napajajo pravilne aminokisline.
TRNA so vez med nukleotidnim zaporedjem mRNA in aminokislinskim zaporedjem proteina. Celice vsebujejo določeno število tRNA, od katerih se vsaka lahko veže le na določeno aminokislino. Vsaka tRNA identificira kodon v mRNA, kar ji omogoča, da aminokislino postavi v pravilen položaj v rastoči polipeptidni verigi, kot je določeno z zaporedjem mRNA.
V eni tRNA so komplementarni odseki, ki tvorijo strugo deteljice, značilno za tRNA. Deteljica je sestavljena iz več struktur stebelnih zank, imenovanih ročice. To so ročica za sprejem, D-roka, Antikodon roka, dodatna roka (samo za nekatere tRNA) in TψC roka.
Roka Antikodona ima antikodon, ki se dopolnjuje s kodonom v mRNA. Odgovoren je za prepoznavanje in vezavo s kodonom v mRNA.
Ko je pravilna aminokislina povezana s tRNA, prepozna kodon te aminokisline na mRNA in to omogoča, da se aminokislina postavi v pravilen položaj, kot ga določa zaporedje mRNA. To zagotavlja, da je zaporedje aminokislin, kodirano z mRNA, pravilno prevedeno. Ta postopek zahteva prepoznavanje kodona iz antikodirne zanke mRNA in zlasti iz treh nukleotidov v njem, poznanih kot antikodon, ki se veže na kodon na podlagi njihove komplementarnosti.
Vezava med kodonom in antikodonom lahko dopušča spremembe v tretji bazi, ker antikodon zanka ni linearna in kadar se antikodon veže na kodon v mRNA, idealna dvoverižna tRNA (antikodon) - mRNA (kodon) molekula ni nastala. To omogoča oblikovanje več nestandardnih komplementarnih parov, ki se imenujejo nihajni osnovni pari. Gre za pare med dvema nukleotidama, ki ne upoštevajo Watson-Cricksovih pravil za seznanjanje baz. To omogoča, da enaka tRNA dekodira več kot en kodon, kar močno zmanjša potrebno število tRNA v celici in znatno zmanjša učinek mutacij. To ne pomeni, da so kršena pravila genskega koda. Protein se vedno sintetizira strogo v skladu z nukleotidnim zaporedjem mRNA.
Zaporedje genov, kodirano v DNK in prepisano v mRNA, sestoji iz trinukleotidnih enot, imenovanih kodoni, od katerih vsaka kodira aminokislino. Vsak nukleotid je sestavljen iz fosfata, saharidne deoksiriboze in ene od štirih dušikovih baz, torej jih je 64 (43) možni kodoni.
Od vseh 64 kodonov jih 61 šifrira aminokislino. Ostali trije, UGA, UAG in UAA, ne kodirajo aminokislin, ampak služijo kot signali za zaustavitev sinteze beljakovin in jih imenujemo stop kodoni. Kodon metionina, AUG, služi kot prevajalni iniciacijski signal in se imenuje začetni kodon. To pomeni, da se vsi proteini začnejo z metioninom, čeprav se včasih ta aminokislina odstrani.
Ker je število kodonov večje od števila aminokislin, je mnogo kodonov »odvečnih«, to je, da lahko isto aminokislino kodirata dva ali več kodonov. Vse aminokisline, razen metionina in triptofana, kodira več kot en kodon. Odvečni kodoni se običajno razlikujejo v svojem tretjem položaju. Odvečnost je potrebna za zagotovitev dovolj različnih kodonov, ki kodirajo 20 aminokislin, zaustavitev in zagon kodonov, genetski kod pa postane bolj odporen proti točkovnim mutacijam.
Kodon v celoti določa izbrani začetni položaj. Vsako zaporedje DNK lahko beremo v treh „bralnih okvirih“, od katerih bi vsak dal popolnoma drugačno zaporedje aminokislin, odvisno od začetnega položaja. V praksi ima pri sintezi beljakovin samo eden od teh okvirov pomembne informacije o sintezi beljakovin; druga dva okvirja ponavadi povzročijo zaustavitvene kodone, kar preprečuje njihovo uporabo za neposredno sintezo beljakovin. Okvir, v katerem je beljakovinsko zaporedje dejansko prevedeno, določa začetni kodon, običajno prvi srečani AUG v zaporedju RNA. Za razliko od stop kodonov, sam začetni kodon ni dovolj za začetek postopka. Za indukcijo transkripcije mRNA in vezave ribosomov so potrebni tudi sosednji primeri.
Prvotno je veljalo, da je genetski zapis univerzalen in da vsi organizmi razlagajo kodon kot isto aminokislino. Čeprav je na splošno tako, so bile ugotovljene nekatere redke razlike v genetskem zapisu. Na primer, v mitohondrijah UGA, ki je ponavadi stop kodon, kodira triptofan, medtem ko sta AGA in AGG, ki običajno kodirata triptofan, stop kodona. Druge primere nenavadnih kodonov smo našli v Protozojih.
Antikodon: Antikodoni so trinukleotidne enote v tRNA, ki se dopolnjujejo s kodoni v mRNA. TRNA omogočajo, da med proizvodnjo beljakovin napajajo pravilne aminokisline.
Codon: Kodoni so trinukleotidne enote v DNA ali mRNA, ki kodirajo specifično aminokislino v sintezi beljakovin.
Antikodon: Antikodoni so vez med nukleotidnim zaporedjem mRNA in aminokislinskim zaporedjem proteina.
Codon: Kodoni prenašajo genetsko informacijo iz jedra, kjer se nahaja DNK, v ribosome, kjer poteka sinteza beljakovin.
Antikodon: Antikodon se nahaja v veji Anticodon molekule tRNA.
Codon: Kodoni se nahajajo v molekuli DNK in mRNA.
Antikodon: Antikodon dopolnjuje zadevni kodon.
Codon: Kodon v mRNA dopolnjuje nukleotidni triplet iz določenega gena v DNK.
Antikodon: Ena tRNA vsebuje en antikodon.
Codon: Ena mRNA vsebuje številne kodone.
Antikodon proti Codon | |
Antikodoni so trinukleotidne enote v tRNA, ki se dopolnjujejo s kodoni v mRNA. TRNA omogočajo, da med proizvodnjo beljakovin napajajo pravilne aminokisline. | Kodoni so trinukleotidne enote v DNA ali mRNA, ki kodirajo specifično aminokislino v sintezi beljakovin. |
Povezava med nukleotidnim zaporedjem mRNA in aminokislinskim zaporedjem proteina. | Prenaša genetske informacije iz jedra, kjer se nahaja DNK, v ribosome, kjer poteka sinteza beljakovin. |
Nahaja se v molekuli tRNA. | Nahaja se v molekuli DNK in mRNA. |
Ena tRNA vsebuje en antikodon. | Ena mRNA vsebuje številne kodone. |
Dopolni kodon. | Komplementarno nukleotidnemu trojčku iz določenega gena v DNK. |