SDS PAGE vs Gel Electrophoresis
Elektroforeza se lahko uporabi za določitev mase predmeta, ki je običajno za beljakovine in deoksiribonukleinsko kislino (DNA). Konec DNK, ko se vnese v kemikalije, lahko pospeši ali upočasni proces obveščanja. DNK markerji znane mase se uporabljajo za približevanje velikosti predmetov, ki potujejo, ko se elektroforeza konča. Elektroforeza je najverjetneje najbolj uporabljeno orodje za molekularne biologe in biokemičare.
V tem postopku se običajno uporabljata dve vrsti elektroforeze. To so elektroforeza z natrijevim dodecil sulfatnim poliakrilamidnim gelom (SDS-PAGE) in naravna gel elektroforeza.
SDS-PAGE je neselektivna metoda gelne elektroforeze, ki se uporablja na področjih, kot so: biokemija, forenzika, biologija in genetika, da se beljakovine ločijo od njihove elektroforetske mobilnosti. SDS je anionsko površinsko aktivno sredstvo, ki ga lahko uporabimo za pomoč pri liziranju celic med ekstrakcijo DNK in za ločevanje beljakovin v SDS-PAGE. Med elektroforezo zmes beljakovin najprej utekočimo v raztopini SDS. Nato snov, imenovano Merkaptoeetanol, nanesemo, da odstranimo disulfidne vezi, da postanejo beljakovine linearne. Nato se začne elektroforeza. Rezultati bi dali dva ostanka molekul, od katerih je ena SDS-PAGE.
Odsotnost SDS-PAGE ni težava, saj gel elektroforeza še vedno omogoča le, da beljakovine ne izgubijo vse svoje sekundarne in terciarne strukture in se ne odprejo v splošno ravne palice.
Medtem domača gel elektroforeza uporablja gel kot antikonvektivno sredstvo. Običajno se uporablja za ločevanje bioloških makromolekul, kot so DNK, ribonukleinska kislina (RNA) in beljakovine. Uporablja se lahko tudi za ločevanje nanodelcev.
Obstajata dva glavna gela, ki se uporabljata v domači gel elektroforezi, in sicer:
Agarozni gel, ki se uporablja za večje molekule. Ta gel ne prepozna majhnih razlik med dvema molekularnima pasovoma. Uporablja se tudi izključno za ločevanje DNK. Vizualizacija agaroznega gela se izvede z mešanico etidijevega bromida.
Poliakrilamidni gel, ki se uporablja za manjše molekule. Ta gel prepozna razlike med molekularnimi pasovi. Poleg DNK lahko loči tudi beljakovine.
Povzetek:
1.SDS-PAGE je neselektivna metoda elektroforeze gela, ki se uporablja na področjih, kot so: biokemija, forenzika, biologija in genetika, da se beljakovine ločijo od njihove elektroforetske mobilnosti, medtem ko se elektroforeza z geli običajno uporablja za ločevanje bioloških makromolekul, kot je DNK, ribonukleinska kislina (RNA) in beljakovine. Uporablja se lahko tudi za ločevanje nanodelcev.
2.Native gel elektroforeza ima dve vrsti, in sicer: agarozni gel in poliakrilamidni gel.