Endonuclease vs Exonuclease
Endonukleaza in eksonukleaza sta nukleazni encimi, ki katalizirata hidrolizo posameznih nukleotidov, prisotnih v verigi DNK. Nukleaze igrajo ključno vlogo pri analizi zaporedja nukleotidov v DNK in RNK.
Izvleček
Eksonukleazni encimi so kategorija encimov, ki se na koncu molekule DNA cepijo do nukleotidov. Dva sklopa DNK se medsebojno dopolnjujeta. Predstavljeni so kot 3 'in 5' kraki. Fosfodiesterske mostove DNA in RNA napadata dva razreda encimov, ki sta predstavljena kot "a" in "b". Encimi iz skupine "a" posebej hidrolizirajo estrsko vez med 3 'ogljikom, fosforna skupina in encimi iz skupine "b" pa hidrolizirajo estrsko vez med 5' ogljikom in fosforno skupino.
Dober primer skupine encima eksonukleaze je strup klopotače in Russellove viperke. Ta strup hidrolizira vse 3 'vezi v DNK ali RNK in tako sprosti nukleotidne enote kot nukleozidne 5' fosfate.
Encimi razreda b so predstavljeni s fosfodiesterazo vranice, ki hidrolizira vse povezave "b" ali 5 'obeh DNA in RNA in tako sprosti samo nukleozidne 3' fosfate.
Endonuclease
Enciduklusni encimi so encimi, ki se cepijo na vezi DNK znotraj molekule. Na koncu polinukleotidne verige ne potrebujejo proste 3 'ali 5' hidroksilne skupine. Endonukleaze napadajo posebne 3 'ali 5' povezave, kjer koli se pojavijo v polinukleotidni verigi.
Endonukleaze so razvrščene tudi v skupine "a" in "b". Deoksiribonukleaza I goveje trebušne slinavke je kategorizirana kot encim razreda "a", ki katalizira hidrolizo nekaterih 3 'povezav DNA, da dobimo oligonukleotide, ki vsebujejo v povprečju približno štiri nukleotidne ostanke..
Deoksiribonukleaza II je še ena endonukleaza razreda "b". Izoliramo ga iz vranice in timusa različnih bakterij in povzroči hidrolizo 5 'povezav, kar povzroči skupino nukleotidov.
Povzetek:
1.Eksonukleaza povzroči hidrolizo nukleotida na koncih, kjer je v polinukleotidni verigi prisotna prosta 3 'ali 5' hidroksilna skupina, medtem ko za eksonukleazo ni potrebna prosta 3 'ali 5' hidroksilna skupina, da povzroči hidrolizo polinukleotidne verige.
2. Aktivnost eksonuklaze povzroči nukleozide, medtem ko aktivnost endonukleaze povzroči oligonukleotide.
3. Delovanje eksonukleaze povzroči majhne enote polinukleotidne verige skoraj takoj, medtem ko aktivnost endokukleze prehaja v fazo zamika, preden sprosti oligonukleotidne skupine.
4.Posne strupe in fosfodiesteraze vranice sta primera eksonuklez, deoksiribonukleaza I in II pa primera endonuklez.