Razlika med agarozo in poliakrilamidom

Agaroza proti Poliakrilamidu

V zvezi z agarozo in poliakrilamidom obstajajo različne razlike, vključno z njihovo fizično zgradbo, strupenostjo in načini izlivanja ter ceno. Te razlike in njihove podobnosti je koristno vedeti, če imate opravka s katero koli od teh vrst gelov.

Ena glavnih razlik med tema dvema geloma je, da se agaroza vlije vodoravno, medtem ko se poliakrilamid vlije navpično. Daleč lažje je na ta vodoravni način vliti agarozo. Agarozo lahko segrejemo, da olajšamo proces izlivanja, čeprav je ne smemo segrevati tako obsežno, da se agaroza konča s taljenjem. Lahko se tudi odločimo, ali bomo za zalivanje agaroze uporabili ozke ali široke pasove. Lahko se vlije s to metodo žlebljenja, in to je ena od njegovih prednosti. Med polivanjem je treba biti zelo previden, saj je agaroza zelo občutljiva in se zlahka zlomi.

Po drugi strani pa, kot rečeno, poliakrilamid vlijemo navpično. Poliakrilamid potrebuje steklene plošče za pomoč pri tem procesu, saj je njegova struktura zelo tanka, zato je potrebna dodatna podpora. Za razliko od agaroze poliakrilamida ni mogoče ponovno segreti in nato naliti.

Agaroza je sestavljena iz mnogih molekul, medtem ko poliakrilamid na splošno sestavlja samo ena velika molekula. Molekule agaroze držijo medmolekularne sile, molekule pa so sestavljene iz DNK. Obstajajo velike in majhne molekule in na splošno se večje molekule lažje ločijo od manjših. Molekula poliakrilamida je sestavljena iz DNK ali beljakovin. Vrzeli med geli poliakrilamida so manjše od tistih med geli agaroze, kar je še ena razlika med tema dvema snovma. Kadar je velikost trakov v agarozi enaka, so v poliakrilamidu različne velikosti trakov. Če je molekula poliakrilamida izpostavljena zraku, se ta ne strdi enakomerno, saj zrak pospeši postopek polimerizacije.

Kar zadeva strupenost, agaroza velja za nestrupeno snov. Medtem ko poliakrilamid velja za enakega, njegov prah velja za strupen, zato je pametno z zaščitnimi ukrepi celo ravnati z geli..

Poliakrilamid se uporablja za sekvenciranje gelov in beljakovinskih gelov. Njegove prednosti so, da ima lahke lastnosti obarvanja in se lahko posuši, da tvori gel. Kupuje se predhodno vlije in je ceneje kot agaroza za približno 5 do 7 $ na gel. (Agaroza je približno 1 dolar na gram). Osebi se priporoča, da ima dovolj izkušenj pred nakupom katerega koli od teh dveh gelov, saj je pogosto pred vsakim nakupom treba poznati število potrebnih vzorcev in koncentracijo gela..

Povzetek:

1.Agaroza se vlije vodoravno, poliakrilamid pa navpično.
2.Agaroza je dražja od poliakrilamida.
3.Agaroza je sestavljena iz mnogih molekul, medtem ko poliakrilamid sestavlja samo ena velika molekula.
4.Nekačen poliakrilamid lahko agarozo ponovno segrejemo.
5.Agaroza velja za nestrupeno snov v vseh oblikah, medtem ko je prah poliakrilamida ugotovljen kot strupen.