Alotropi so različne strukturne modifikacije elementa, medtem ko izomeri so kemične spojine, ki imajo isto molekularno formulo, vendar imajo različne strukturne formule.
Določeni elementi lahko obstajajo v dveh ali več različnih oblikah. Te oblike se imenujejo alotropi pri čemer so atomi elementa na drug način povezani. Na primer, dioksigen (O2), ozon (O3), tetraoksigen (O4) in oktaoksigen (O8) so
Tako alotropija kot izomerizem sta bila koncepta, ki jih je predlagal švedski znanstvenik Jöns Jakob Berzelius. Predlagal je koncept alotropija leta 1841. Po sprejetju Avogadrove hipoteze leta 1860 se je razumelo, da lahko elementi obstajajo kot poliatomske molekule, dva alotropa kisika pa sta bila prepoznana kot O2 in O3. V začetku 20. stoletja je bilo ugotovljeno, da so tudi drugi primeri, kot je ogljik, posledica razlik v strukturi kristalov.
Izomerizem so prvič opazili leta 1827, ko je Friedrich Woehler pripravil cijansko kislino in ugotovil, da so bile njegove elementarne sestave identične fulminski kislini (ki jo je pripravil Justus von Liebig v prejšnjem letu) precej drugačne. Ta ugotovitev je izzvala prevladujoče kemijsko razumevanje tistega časa, ki je menilo, da so kemijske spojine lahko drugačne le, če imajo različne elementarne sestave. Po tem, ko so bila narejena dodatna odkritja iste vrste, kot je Woehlerjevo odkritje iz leta 1828, da je sečnina imela enako atomsko sestavo kot kemično ločen amonijev cianat, je izraz uvedel Jöns Jakob Berzelius izomerizem opisati pojav.
Različni razredi izomerov vključujejo stereoizomere, enantiomere in geometrijske izomere.
Vrste izomerov