Razlika med ciljano in nenamerno proteomiko

Ključna razlika med ciljno in nenamerno proteomiko je v tem, da ciljno usmerjena proteomika je namenjena merjenju številčnosti določenega proteina, medtem ko nezahtevna proteomika ne cilja na določen protein.

Proteomics je obsežna raziskava beljakovin, njihovih struktur in funkcij. Študira celotno beljakovinsko dopolnilo v celici, tkivu ali organizmu pod specifičnimi pogoji. Obstajata dve vrsti proteomikov kot ciljna proteomika in nenadzorovana proteomika.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je ciljna proteomika
3. Kaj je nenadzorovana proteomika
4. Podobnosti med ciljno in nenamerno proteomiko
5. Primerjava ob strani - Ciljna proti nenadzorovani proteomiki v tabeli
6. Povzetek

Kaj je ciljna proteomika?

Kot že ime pove, ciljani proteomiki ciljajo na specifičen protein ali peptid v kompleksni mešanici proteinov za analizo. Nato analizira prisotnost in količino tega izbranega specifičnega proteina. Ta metoda je mogoča samo za en vzorec ali za več vzorcev. Ta metoda je primerna celo za določeno skupino beljakovin. Rezultat je bolj natančnih, količinskih in občutljivih podatkov. Poleg tega masna spektrometrija skupaj s ciljano proteomiko daje natančnejše zanesljive meritve. Ta metoda za analizo uporablja trojni kvadrapolni masni spektrometer (QQQ).

Slika 01: Proteomika

Ciljna proteomika je primerna metoda, če želite preveriti, ali je cilj metanja v tla dejansko zaustavljen ali če želite količinsko določiti določen protein / peptid v krvnem serumu, cerebralni tekočini ali v celičnem lizatu itd. Uporabite ga lahko tudi, če želite preveriti, ali je določen protein različno izražen v vzorcih ali med časovnim poskusom.

Kaj je nenadzorovana proteomika?

Nenačrtovani proteomiki, kot že omenjeno ime, za svojo analizo ne ciljajo na določen protein ali peptid. Odkritja proteomika je drugo ime za nenadzorovane proteomike. V resnici gre za bolj 'globalno' analizo. Na splošno je izvajanje nenadzorovanih proteomikov odgovor na vprašanje "kateri beljakovine ali beljakovine so v tem vzorcu ali v več vzorcih?". Ta metoda ni občutljiva kot ciljna proteomika. Lahko pa prepozna in meri številne beljakovine, vključno z novimi beljakovinami. Nenačrtovana proteomika lahko ustvari kvantitativne in kvalitativne meritve.

Kakšne so podobnosti med ciljno in nenamerno proteomiko?

• Tako ciljno usmerjeni in nenamerni proteomiki merijo beljakovine v vzorcih.
• Pomembni so pri analizi proteomov.
• Te metode uporabljajo masno spektrometrijo.

Kakšna je razlika med ciljno in nenamerno proteomiko?

Prvič, ciljna proteomika je določitev prisotnosti in količine določenega proteina ali peptida v kompleksni mešanici proteinov. V nasprotju s tem je nenamerna proteomika kvantitativna in kvalitativna študija beljakovin v vzorcu ali vzorcih, ne da bi ciljala na določen protein. Ciljni proteomiki se izvajajo z vnaprej izbranimi ali ciljnimi proteini, medtem ko se za ugotavljanje vrst beljakovin v tem vzorcu izvaja nenadzorovana proteomika. Poleg tega je ciljna proteomika občutljivejša od nenamerne proteomike.

Povzetek - Ciljni proti nenadzorovani proteomiki

Če povzamemo, sta ciljno usmerjena in nenamerna proteomika dve vrsti študij beljakovin. Kot nakazujejo njihova imena, ciljani proteomiki ciljajo na določen protein, medtem ko neoteženi proteomiki ne ciljajo na določen protein. To je razlika med ciljano in nenamerno proteomiko.

Referenca:

1. "Ciljna proteomika." UC Davis Proteomics Core, na voljo tukaj.
2. "Proteomics / Uvod v Proteomics." Teorija glasbe / načini - Wikibooks, Odprte knjige za odprti svet, na voljo tukaj.

Vljudnost slik:

1. "Proteomics" avtorja Xxl7441 v angleški Wikibooks - Preneseno iz en.wikibooks v Commons (Public Domain) prek Commons Wikimedia