Razlika med ukoreninjenim in koreninskim filogenetskim drevesom

Ključna razlika - Ukoreninjeno proti neukoreninjenemu filogenetskemu drevesu
 

Filogenija je pomembno področje, ki skozi čas raziskuje življenje na zemlji. Razkriva povezavo med organizmi z njihovimi predniki in potomci. Razmerja med organizmi so shematično predstavljena z različnimi drevesnimi predstavitvami, kot so dendogram, kladogram, fenogram, filogram itd. Filogenetsko drevo je razvejano drevesno diagramo, ki razlaga filogenetske odnose med organizmi s količino evolucijske razdalje. Obstajata dve glavni vrsti filogenetskih dreves, imenovani zakoreninjeni in koreninjeni. Ključna razlika med zakoreninjenim in zakoreninjenim filogenetskim drevesom je v tem ukoreninjeno drevo prikazuje najbolj bazalnega prednika drevesa medtem zakoreninjen filogenetsko drevo ne kaže korenine prednikov.

VSEBINA
1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je zakoreninjeno filogenetsko drevo
3. Kaj je koreninsko filogenetsko drevo
4. Primerjava ob strani - zakoreninjeno proti neukoreninjenemu filogenetskemu drevesu
5. Povzetek

Kaj je zakoreninjeno filogenetsko drevo?

Ukoreninjeno filogenetsko drevo služi kot koristen diagram, ki prikazuje evolucijsko zgodovino. Ima bazalno vozlišče, ki se imenuje koren, ki predstavlja skupnega prednika vseh skupin drevesa. Koren drevesa velja za najstarejšo točko na drevesu, ki predstavlja zadnjega skupnega prednika vseh skupin, vključenih v drevo. Zato zakoreninjeno drevo kaže smer evolucijskega časa. Iz ene same vrste ukoreninjenega drevesa je mogoče najti skupni prednik ali prednika vrst, če sledimo nazaj do bazalnega vozlišča. Ker zakoreninjeno drevo prikazuje smer evolucijskega časa, je mogoče najti starejše ali novejše skupine, ki jih ima. Ukoreninjeno drevo se lahko uporablja za preučevanje celotnih skupin organizmov. Natančno ukoreninjenje filogenetskega drevesa je pomemben in ključen dejavnik, saj lahko nepravilno ukoreninjenje povzroči napačne razlage genetskih sprememb med organizmi in njihovo usmerjenost evolucije..

Slika 01: Ukoreninjeno filogenetsko drevo

Kaj je neokoreninjeno filogenetsko drevo?

Nekoreninjeno filogenetsko drevo je filogenetski diagram, ki nima skupnega prednika ali bazalnega vozlišča. Ta vrsta drevesa ne kaže nastanka evolucije interesnih skupin. Prikazuje samo razmerje med organizmi, ne glede na smer evolucijske časovne črte. Zato je težko raziskati evolucijske odnose skupin glede na čas z uporabo nekoreniniranega drevesa.

Obstajata dva glavna načina za izkoreninjenje filonetskega drevesa brez korenin. So

• Iskanje zunanje skupine - to zahteva predhodno znanje o razmerjih med taksoni. Nato lahko takson, ki leži zunaj skupine, uporabi kot skupino za risanje zakoreninjenega filogenetskega drevesa

• Iskanje vmesne točke ali razdalje - Sredino točke najbolj oddaljenih dveh taksonov v drevesu lahko predpostavimo kot koren za filogenetsko drevo.

Slika 02: Filonetsko drevo brez korenin

Kakšna je razlika med ukoreninjenim in koreninskim filogenetskim drevesom?

Ukoreninjeno proti neukoreninjenemu filogenetskemu drevesu
Ukoreninjeno filogenetsko drevo je diagram, ki prikazuje zadnjega skupnega prednika skupin.	Nekoreninjeno filogenetsko drevo prikazuje odnose med organizmi, ne da bi pokazalo skupnega prednika.
Vozlišče
Ima vozlišče (root).	Nima vozlišča.
Smer evolucije
Ima smer, ki označuje čas evolucije.	Ne določa evolucijskega odnosa.
Odnos do drugih
Drevo omogoča določitev razmerja med predniki in potomci med skupinami.	Drevo ne dovoli govoriti o odnosu prednik - potomec.

Povzetek - Ukoreninjeno proti neukoreninjenemu filogenetskemu drevesu

Filogenetsko drevo predstavlja evolucijske poti in povezave med organizmi z uporabo razvejanih drevesnih diagramov. Filogenetski tras se lahko ukorenini ali ukorenini. Ukoreninjeno drevo ima na dnu vozlišče, ki predstavlja skupnega prednika, ki povezuje vse interesne skupine. Nekoreninjeno drevo prikazuje odnose med organizmi. Vendar ne prikazuje skupnega prednika, ki si ga delijo vse skupine. To je razlika med ukoreninjenim in koreninskim filogenetskim drevesom.

Reference:
1. Dejstva o "drevesu": zakoreninjena proti neobrezanim drevjem. " Nacionalni center za informacije o biotehnologiji. Ameriška nacionalna medicinska knjižnica, n.d. Splet. 04. april 2017
2. Graham, Sean W., Richard G. Olmstead in Spencer C. H. Barrett. "Ukoreninjenje filogenetskih dreves z oddaljenimi skupinami: študija primerov komelinoidnih monokotov." Molekularna biologija in evolucija. Oxford University Press, 01. oktober 2002. Splet. 04. april 2017