Razlika med fusion in polimerazo Taq

Ključna razlika - Phusion proti Taq Polimeraza
 

DNK polimeraze so v tehniki molekularne biologije široko uporabljene encime in so seveda prisotne tudi v vseh organizmih, ki se podvajajo z DNK. So ključni polimerizacijski encimi, ki se vključijo med razmnoževanjem. DNA polimeraza lahko doda nukleotide na prosti 3 'konec verige DNA in s tem povzroči podaljšanje novega sklopa. Trenutno je zaradi razvoja molekularne biologije v diagnostiki bolezni in industrijski uporabi pomembna izdelava polimeraz z različnimi koristnimi lastnostmi. To poveča natančnost metode in jo naredi hitrejšo tehniko. Fusion in polimeraza Taq sta dva tržno proizvedena termostabilna encima polimeraze, ki se uporabljata v posebnih molekularnih aplikacijah. Fusion je DNK polimeraza, izolirana iz Pyrococcus furiosus in se uporablja predvsem v poskusih s kloniranjem za povečanje zvestobe. Taq DNA polimeraza je standardna DNK polimeraza, ki se uporablja v verižni reakciji polimeraze (PCR) in je izolirana iz termostabilne bakterije; Thermus aquaticus. The ključna razlika med obema encimoma je izvorni mikroorganizem. Fusion je izoliran iz ekstremofila, Pyrococcus furiosus ker je polimeraza Taq izolirana iz termofila, Thermus aquaticus.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je fusion
3. Kaj je Taq polimeraza
4. Podobnosti Phusion in polimeraze Taq
5. Primerjava ob strani - polimeraza phusion proti Taq v tabeli
6. Povzetek

Kaj je Fusion?

Fusion DNA polimeraza je nova polimeraza, ki nastane z izolacijo encima iz Pyrococcus furiosus, ki je skrajna Arhaea. Ti mikrobi prebivajo v izjemno visokotemperaturnih pogojih, zaradi česar polimeraza postane zelo toplotno stabilna polimeraza. Fusion polimeraza se uporablja za doseganje skrajne zvestobe običajni termostabilni polimerazi; Taq polimeraza. Fusion polimeraza lahko poveča dolge predloge do 7,5 kb genomske DNK. Optimalna sposobnost polimerizacije Phusion polimeraze je 72⁰ C. Phusion se uporablja tudi pri kloniranju izdelkov za sekvenciranje, ekspresijsko analizo in mutacijsko analizo.

Fusion DNA polimeraza ima 3 '- 5' eksonukleazno delovanje. To omogoča lektoriranje na novo sintetiziranega pramena po sintezi. Zato se nukleotidne neusklajenosti zlahka popravijo. Tako ima manjšo stopnjo napak. Splošne prednosti Phusion polimeraze so;

• Izjemna zvestoba
• Velika hitrost in skrajšani čas podaljšanja
• Močne reakcije in zahtevajo minimalno optimizacijo
• Visoki donosi

Slika 01: Fusion

Glavna pomanjkljivost Phusion polimeraze je, da je ta inhibiran v prisotnosti deoksiuridin trifosfata (dUTP). Ko se dUTP naberejo v reakcijski mešanici, lahko to zavira delovanje Fusion polimeraze. To preprečimo z obdelavo reakcijske mešanice z dUTPazo pred dodajanjem encima. Trenutno se kot zdravilo za to težavo uporablja različica Phusion polimeraze, odporne na dUTP, namesto Phusion polimeraze.

Kaj je polimeraza Taq?

Taq DNA polimeraza izum je revolucioniral področje molekularne biologije. Rešila je veliko težavo pri pomnoževanju DNK. Taq DNA polimeraza je toplotno stabilen encim polimeraze, ki se ekstrahira in izolira iz termofilne bakterije, Thermus aquaticus. Odkritje teh encimov vodi v razvoj PCR. Ta encim je omogočil uporabo verižne reakcije polimeraze pri amplifikaciji DNA namesto običajnih napornih klonirnih tehnik. PCR se zdaj uporablja v molekularni diagnostiki, kmetijskih in industrijskih področjih z veliko novimi različicami, dodanimi tehniki.

Slika 02: Taq polimeraza

Taq DNA polimeraza deluje v optimalnem temperaturnem območju med 72⁰C - 80⁰C. Taq DNA polimeraza zahteva so-faktor; magnezij za svojo funkcijo. Taq polimeraza nima sposobnosti lektoriranja 3 '- 5', zato je stopnja napake Taq DNA polimeraze visoka v primerjavi z novejšimi vrstami DNK polimeraze, kot je Phusion polimeraza itd. Toda priljubljenost Taq DNA polimeraze ostaja enako po vsem svetu znanosti zaradi priročnosti in prožnosti encima.

Kakšne so podobnosti med phusion in polimerazo Taq?

• Encimi polimeraze Phusion in Taq so polimerizirajoči encimi, ki lahko dodajo nukleotide na 3 'prosti konec verige DNA.
• Polimeraze Phusion in Taq zahtevajo zaporedje osnovnega premaza za začetek polimerizacije.
• Polimeraze Phusion in Taq so toplotno stabilne.
• Polimeraze Phusion in Taq se uporabljajo v PCR mehanizmih za pomnoževanje DNK.
• Ko dodamo polimerazo v reakcijsko zmes, sta polimerazi Phusion in Taq dodani zadnji, da zagotovimo učinkovitost encima.
• Polimeraze Phusion in Taq se komercialno sintetizirajo za eksperimentalne namene molekularne biologije.
• Polimeraze Phusion in Taq za dokončanje svoje funkcije potrebujejo kofaktor.

Kakšna je razlika med fusion in polimerazo Taq?

Fusion proti polimerazi Taq
Fusion je DNK polimeraza, izolirana iz Pyrococcus furiosus in se uporablja predvsem v poskusih s kloniranjem za povečanje zvestobe.	Taq DNA polimeraza je standardna DNK polimeraza, ki se uporablja v verižni reakciji polimeraze (PCR) in je izolirana iz termostabilne bakterije, Thermus aquaticus.
Izvorni organizem
Fusion se ekstrahira iz ekstremofilnih arhej - Pyrococcus furiosus.	Ta literarna dela segajo od časa kolonizacije do obdobja dekolonizacije.
Sposobnost dokazila
3 '- 5' dokazna sposobnost branja je prisotna v fusionu.	3 '- 5' dokazna sposobnost branja v polimerazi Taq ni.
Zvestoba
Phusion ima visoko zvestobo.	Taq polimeraza kaže nizko natančnost.
Ojačanje
Fusion je sposoben ojačati dolge fragmente DNK.	Taq polimeraza lahko poveča mnogo krajših fragmentov DNK.
dUTP Zastrupitev
Fusion delovanje zavira zaradi akumulacije neparno.	Taq polimeraza ne zavira dUPT.

Povzetek - Fusion proti Taq polimeraza

Phusion in Taq DNA polimeraza sta dve toplotno stabilni polimerazi, ki se uporabljata v PCR tehnikah. Fusion je polimeraza, izolirana iz ekstremofila, Pyrococcus furiosus ker je Taq izoliran iz termostabilnih bakterij Thermus aquaticus. Taq odkrivanje DNA polimeraze vodi k izumu PCR. Fusion ima veliko prednosti pred Taqom, zaradi česar je Phusion boljša možnost pri ustvarjanju DNK z visoko natančnostjo. Vendar se polimeraza Taq še vedno uporablja kot standardni encime polimeraze v PCR. To je razlika med Phusion in Taq polimerazo.

Referenca:

1.Biolabi, Nova Anglija. "Taq DNA polimeraze." New England Biolabs: reagenti za industrijo znanosti o življenju. Na voljo tukaj  
2. "Fusion DNA polimeraza." New England Biolabs. Na voljo tukaj 

Vljudnost slik:

1.'GAM ponazoril Nivin Nasri'By NivinN - Lastno delo, (CC BY-SA 4.0) prek Commons Wikimedia  
2.'Taq'By Adenosine - Lastno delo, (CC BY-SA 3.0) prek Commons Wikimedia