Razlika med motivom in domeno

The ključna razlika med motivom in domeno je, da je motiv ni neodvisno stabilen, medtem ko je domena neodvisno stabilna.

Beljakovine so pomembne biološke makromolekule, ki so prisotne v našem telesu. Po drugi strani pa bo genska koda gena odločala o aminokislinskem zaporedju proteina. Poleg tega imajo proteini primarno, sekundarno in terciarno strukturo. Primarna struktura je aminokislinsko zaporedje polipeptidne verige. Ko se polipeptidne verige zložijo med seboj, tvori sekundarno strukturo proteina. Alfa vijaki, beta listi in nad-sekundarne strukture pripadajo sekundarnim strukturam. Določene skupine nad-sekundarnih elementov so znane kot proteinski motivi. Terciarna struktura proteina se nanaša na njegovo tridimenzionalno strukturo, ki določa funkcijo proteina. Domena je prepognjen odsek molekule proteina, ki je kroglast in ima diskretno funkcijo. Je temeljna funkcionalna in tridimenzionalna struktura proteina.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je motiv
3. Kaj je Domena
4. Podobnosti med motivom in domeno
5. Primerjava zraven - motiv proti domeni v tabeli
6. Povzetek

Kaj je motiv?

Motiv je določena skupina super sekundarnih elementov beljakovin, kot so alfa vijačnice in beta strukture. So nekakšni vzorci, ki so prisotni v različnih beljakovinah. Motivi opisujejo vzorce zgibanja sekundarnih strukturnih elementov in njihove interakcije. Ti zložljivi vzorci se stabilizirajo s podobnimi vezmi, ki so prisotne v terciarnih strukturah. Vendar niso tako zapletene kot terciarne strukture.

Slika 01: Motiv

So preproste kombinacije sekundarnih struktur beljakovin. Motiv sam po sebi ni stabilen. Poleg tega motivi pojasnjujejo strukturo proteina, vendar ne napovedujejo funkcije proteina. Primeri beljakovinskih motivov so motiv beta-alfa-beta, grški ključni motiv, Beta sod, motiv Beta-meander itd..

Kaj je Domena?

Domena je temeljna, funkcionalna in tridimenzionalna enota proteina. Izvaja določeno funkcijo. En sam protein lahko ima več različnih domen. Vsaka domena je samostojna enota. Je kroglasta struktura. Odgovoren je za določeno funkcijo ali interakcijo. Domene se lahko uporabijo za hipotezo funkcije beljakovine brez lastnosti. Pri analizi beljakovin je treba nujno upoštevati, ker so domene funkcionalne enote proteina.

Slika 02: Tri različne domene piruvat kinaze

Domene so zelo stabilne in kompaktne strukture. Lahko jih je mogoče ločiti od drugih regij. Piruvatkinaza ima tri ločene domene, kot je prikazano na sliki 02. Dolžina domene se lahko razlikuje, povprečna dolžina pa je 100 aminokislin. Vsaka domena vsebuje hidrofobno jedro, zgrajeno iz sekundarnih strukturnih enot. Več domen skupaj tvori terciarno strukturo proteina.

Kakšne so podobnosti med motivom in domeno?

• Motiv in domena sta enoti, prisotni v samih molekulah beljakovin.
• Uporabni so pri razvrščanju beljakovinskih družin.

Kakšna je razlika med motivom in domeno?

Motiv je določena skupina super sekundarnih elementov beljakovin, kot so alfa vijačnice in beta strukture, medtem ko je domena funkcionalna enota proteina. Poleg tega je motiv sekundarna struktura, medtem ko je domena odgovorna za terciarno strukturo proteina. Poleg tega je domena za razliko od motiva samostojna enota. Prav tako domena prikazuje funkcijo proteina, medtem ko motiv ni. To so glavne razlike med motivom in domeno. Spodnja infografika prikazuje tabelarno razliko med motivom in domeno.

Povzetek - Motiv proti domeni

Motiv je razporeditev sekundarnih struktur beljakovinske molekule. Običajno ni stabilen sam, za razliko od domene. Domena je neodvisno stabilna struktura proteina. Torej je lahko del ali celotna beljakovinska molekula. Je tridimenzionalna temeljna funkcionalna enota proteina. Poleg tega ima funkcijo in je samostojna enota. Motiv je lahko del domene. Toda domena ne more biti del motiva. To je razlika med motivom in domeno.

Referenca:

1. "Proteinska domena." Wikipedia, fundacija Wikimedia, 31. julij 2018. Dostopno tukaj

Vljudnost slik:

1. "Ključni motiv proteina proti antraksu", avtor NatelewisDerivative (CC BY-SA 3.0) prek Commons Wikimedia
2. "Področja proteinskih piruvat kinaz" Thomas Splettstoesser - Lastno delo, (CC BY-SA 3.0) prek Commons Wikimedia