Razlika med vstavitvijo in nadomestnimi vektorji

The ključna razlika med vstavitvenimi in nadomestnimi vektorji je, da ima vstavitveni vektor možnost vstavljanja zmernih dolžin tuje DNK, medtem ko ima nadomestni vektor možnost, da sprejme večje dolžine tuje DNK.

Faški vektorji so bakteriofagi, ki se uporabljajo za kloniranje. Obstajata dve vrsti faških vektorjev; so vstavitveni in nadomestni vektor. Vsi faktorski vektorji so sestavljeni iz nebistvenih genov. Vendar je treba te gene odstraniti iz fagov, da bi olajšali nove tuje DNK vstavke.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj so vstavitveni vektorji
3. Kaj so nadomestni vektorji
4. Podobnosti med vstavitvijo in nadomestnimi vektorji
5. Primerjava drug ob drugem - vstavitev in nadomestni vektorji v tabeli
6. Povzetek

Kaj je vstavitveni vektor?

Najprej je vstavitveni vektor najpreprostejša oblika vektorjev kloniranja lambde. V resnici gre za vrsto faškega vektorja, ki ima edinstveno restrikcijsko mesto, vneseno znotraj vektorskega genoma na položaju neobvezne DNK. Nadalje fago DNA ostane brez odstranitve. To ne-odstranjevanje fazne DNK zmanjša velikost vložkov (tuje DNK), ki jih je treba klonirati znotraj vektorja. Poleg tega so ti vektorji uporabni pri kloniranju in ekspresiji cDNA. GT10, GT11 in Zap so primeri tega vektorja.

Slika 01: Lambda fage

Vstavitveni vektor je sestavljen iz enega samega mesta za prepoznavanje. Primarna funkcija tega vektorja je razvijanje knjižnic cDNA, ki izhajajo iz eukariotskih zaporedj mRNA. Poleg tega lahko sprejme le dolžine tujih DNK, ki se gibljejo med 05-11 kb. Prav tako ima edinstveno mesto cepitve za vstavljanje tuje DNK.

Kaj so nadomestni vektorji?

Nadomestni vektor oz substitucijski vektor je vrsta faznega vektorja, ki se je razvil iz odstranitve srednjega področja "fragmenta polnila" fagne DNA. Želeni vložek tuje DNK nadomešča fago DNA.

Slika 02: Nadomestni vektor

Nadomestni vektorji so pomembni pri ustvarjanju genskih knjižnic, kot sta EMBL4 in Charon40. Ti vektorji lahko sprejmejo večjo dolžino tuje DNK, ki se giblje med dolžinami 08-24kb. Polnilno območje je sestavljeno tudi iz gena, zaradi katerega faktorski vektor ne deluje v notranjosti bakterijskega gostitelja.

Kakšne so podobnosti med vstavitvijo in nadomestnimi vektorji?

• Vstavitveni in nadomestni vektorji so fazni vektorji.
• Oba vektorja vsebujeta tuje DNK vstavke.
• Oba sta v pomoč pri ustvarjanju knjižnic DNK.

Kakšna je razlika med vstavitvijo in nadomestnimi vektorji?

Vstavljanje vs nadomestni vektorji
Vstavitveni vektor je vrsta faznega vektorja, ki ima na mestu neobvezne DNK restrikcijsko mesto, ki je vneseno znotraj genoma faga.	Nadomestni vektor je vrsta faznega vektorja, ki se je razvil iz odstranitve srednjega področja "fragmenta polnila" fagne DNA
Velikost vstavljenih fragmentov
Dolžina 05-11 kb	Dolžina 08-24 kb
Fragment polnila
Brez drobca polnila	Fragment polnila se nadomesti s tujim vložkom
Funkcija
Pomembno za ustvarjanje knjižnic cDNA	Pomembno pri ustvarjanju knjižnic genomov
Primeri
GT10, GT11 in Zap so primeri	EMBL4 in Charon40 sta primera
Mesto cepitve
Prisotno je edinstveno mesto cepitve	Mesto cepitve vsebuje gene, ki niso pomembni za litski cikel

Povzetek - Vstavljanje proti nadomestnim vektorjem

Tako vstavitveni kot nadomestni vektorji sta dve vrsti faških vektorjev. Oba vektorja imata omejitvena mesta, ki olajšajo namestitev novih tujih DNK vstavkov. Vstavitveni vektorji so pomembni pri ustvarjanju knjižnic cDNA, nadomestni vektorji pa so pomembni pri ustvarjanju genskih knjižnic. Poleg tega vstavljeni vektorji z zmerno dolžino vstavijo DNK. Toda nadomestni vektorji lahko sprejmejo večje dolžine tujih vstavkov DNK. Na splošno je to ključna razlika med vstavitvijo in nadomestnimi vektorji.

Referenca:

1. Hust, P, et al. "Učinkovitost vstavitve v primerjavi z nadomestnim vektorjem, ki cilja na različne kromosomske lokuse." Molekularna in celična biologija, Ameriška nacionalna medicinska knjižnica, december 1994, dostopno tukaj.
2. "Lambda vstavitveni vektorji." Biology 335 Opombe predavanj - Lambda vektorji, na voljo tukaj.
3. "Nadomestni vektor." Nadomestni vektor - Terminologija molekularne biologije za nadomestni vektor - GenScript, na voljo tukaj.

Vljudnost slik:

1. "Lambda phage" avtorice Lizanne Koch - lastno delo s ChemBioDraw (Public Domain) prek Commons Wikimedia