Razlika med Haplogroup in Haplotype

The ključna razlika med haplogrupo in haplotipom je to haplogrupa se nanaša na skupino podobnih haplotipov, ki imajo skupnega prednika, medtem ko se haplotip nanaša na niz alelov, ki so bili podedovani skupaj iz roda v rod zaradi genetske povezanosti.

Gen v prvi vrsti sestavljata dva alela. V kromosomih je na tisoče genov. Pri ločevanju kažejo križanke in genetske rekombinacije. Vendar pa se nekateri aleli genov nahajajo zelo blizu drug drugega. Z enostavnimi besedami ti aleli kažejo genetsko povezavo. Zato verjetno ne bodo prekrižali ali rekombinirali. Namesto tega vedno težijo k skupnemu prenosu iz roda v rod. Skladno s tem je haplotip kombinacija alelov ali sklopa enojnih nukleotidnih polimorfizmov, ki so prisotni na istem kromosomu in se podedujejo skupaj po rodovih od enega samega starša. Haplogroup je skupina podobnih haplotipov, ki imajo skupnega prednika.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je Haplogroup 
3. Kaj je haplotip
4. Podobnosti med Haplogroup in Haplotype
5. Primerjava ob strani - Haplogroup vs Haplotype v tabeli
6. Povzetek

Kaj je Haplogroup?

Haplogroup je skupina podobnih haplotipov, ki imajo skupnega prednika. Z drugimi besedami, haplogrupa je kombinacija alelov, prisotnih v različnih kromosomih, ki se dedujejo skupaj. Ti aleli so prisotni zelo blizu drug drugemu. Haplotipi v haplogrupi imajo podobne vzorce in so sorodni potomci, saj imajo skupnega prednika. Tako je enostavno napovedati haplogrupno skupino iz haplotipov.

Slika 01: Haplogroup

Pri človeku obstajata dve najpogostejši haplogrupi. Gre za Y kromosomske haplogrupe, ki prehajajo od očeta do sina, in mitohondrijske haplogrupe DNA, ki prehajajo od matere do hčere ali sina.

Kaj je Haplotip?

Haplotip je niz alelov, ki se podedujejo skupaj. Ti aleli so prisotni v istem kromosomu zelo blizu drug drugemu zaradi genske povezanosti. Zato ni možnosti za rekombinacijo ali križanje. Zato prehajajo skupaj iz roda v rod. Ti aleli so lahko aleli posameznega gena ali aleli v več genih. Haplotip se lahko nanaša tudi na skupino enojnih nukleotidnih polimorfizmov, ki so prisotni na istem kromosomu. Tako gre za nabor variacij DNK ali polimorfizmov, ki so podedovani skupaj.

Slika 02: Enojni nukleotidni polimorfizem

Informacije o haplotipih so koristne pri raziskovanju vpliva genov na bolezni. Z analizo haplotipov in haplotipov dreves lahko genetiki odkrijejo genomatska področja, povezana z boleznijo, in določijo vzorce genske variacije, povezane z boleznimi. Poleg tega so uporabni med kartiranjem genov pri nameščanju genetskih markerjev na prava mesta na kromosomih.

Kakšne so podobnosti med Haplogroup in Haplotype?

• Haplogroup sestavljajo podobni haplotipi.
• Pokažejo genetske povezave.
• Crossovers ali genetska rekombinacija v haplotipih in haplogrupa ni.

Kakšna je razlika med Haplogroup in Haplotype?

Haplogroup je kombinacija alelov, prisotnih v različnih kromosomih, ki se dedujejo skupaj. Sestavljen je iz podobnih haplotipov, ki si delijo skupnega prednika. Po drugi strani je haplotip niz alelov, ki jih najdemo v istem kromosomu in se skupaj generirajo. Torej, to je ključna razlika med haplogrupo in haplotipom.

Spodnja infografija povzema razliko med haplogrupo in haplotip.

Povzetek - Haplogroup vs Haplotype

Haplogroup je skupina podobnih haplotipov, ki imajo skupnega prednika. Na drugi strani je haplotip kombinacija alelov ali sklopa enojnih nukleotidnih polimorfizmov, ki so prisotni na istem kromosomu, ki se generacijam prenašajo skozi generacije. Zato je to ključna razlika med haplogrupo in haplotipom. Haplotipi omogočajo enostaven način napovedovanja haplogrupov, saj je haplogrupa sestavljena iz podobnih haplotipov.

Referenca:

1. "Haplotip." Genome.gov, na voljo tukaj.
2. "Raziskovalna skupina." Wikipedia, fundacija Wikimedia, 8. julij 2019, dostopno tukaj.

Vljudnost slik:

1. "Molekularna ločitev" Wobble - Lastno delo (Public Domain) prek Commons Wikimedia
2. "Dna-SNP" po modelu SNP David Eccles (gringer) (CC BY 4.0) prek Commons Wikimedia