Razlika med splošnimi in posebnimi faktorji transkripcije

Ključna razlika - splošno vs specifični transkripcijski faktorji
 

Transkripcijski faktorji zahtevajo polimerazo RNA, da deluje na verigi DNA predloge pri sintezi mRNA. Obstajajo različne vrste faktorjev transkripcije. Ti transkripcijski faktorji tvorijo kompleks z nizom DNK. Bodisi spremenijo potrditev predloga predloge ali povečajo afiniteto encima RNA polimeraze do sinteze mRNA v procesu imenovane transkripcije. Obstajata dve glavni vrsti faktorjev transkripcije. So splošni ali bazni transkripcijski faktorji in posebni transkripcijski faktorji. Splošni faktorji transkripcije so dejavniki, ki se uporabljajo za tvorbo kompleksa pred iniciacijo med postopkom prepisovanja. Prisotni so v skoraj vseh evkariotih, pri prokariotih pa tvorijo manj zapleten kompleks. Specifični transkripcijski faktorji so bodisi ojačevalci bodisi zaviralci, ki so specifična zaporedja DNK, ki aktivirajo ali potlačijo splošni proces prepisovanja. Nekateri specifični transkripcijski faktorji lahko sami spreminjajo zaporedje DNK. The ključna razlika med splošnimi transkripcijskimi faktorji in specifičnimi transkripcijskimi faktorji temelji na funkcionalnosti. Splošni transkripcijski faktorji sodelujejo pri tvorbi prediniciacijskega kompleksa procesa prepisovanja, medtem ko specifični transkripcijski faktorji sodelujejo bodisi v aktiviranju bodisi zatiranju postopka prepisovanja.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj so splošni faktorji transkripcije
3. Kaj so specifični transkripcijski faktorji
4. Podobnosti med splošnimi in posebnimi faktorji transkripcije
5. Primerjalna primerjava - splošni in posebni faktorji transkripcije v tabeli
6. Povzetek

Kaj so splošni faktorji transkripcije?

Splošno oz Bazalni dejavniki transkripcije so dejavniki, ki sodelujejo pri tvorbi iniciacijskega kompleksa med prepisovanjem. Bistveni so za postopek prepisovanja, zato igrajo ključno vlogo pri uspešni transkripciji. Obstaja šest ključnih dejavnikov transkripcije. So; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF in TFIIA. Med oblikovanjem iniciacijskega kompleksa igrajo različne vloge.

1. TFIID - Ta transkripcijski faktor (TF) sodeluje pri prepoznavanju promocijskega zaporedja (polje TATA).
2. TFIIB - TFIIB prepoznava kompleks promotorja / TFIID. To daje signal za vezavo glavnega kataliziranega encima RNA polimerazo.
3. TFIIF - Ta transkripcijski faktor je vezan na polimerazo RNA. TFIIF tako sodeluje v postopku z rekrutacijo polimeraze RNA na pravilno lokacijo.
4. TFIIE in TFIIH - Vezava teh transkripcijskih faktorjev pomeni konec nastanka prediniciacijskega vezavanja. Povezovanje le-teh povečuje učinkovitost tvorbe prediniciacijskega kompleksa.
5. TFIIA spodbuja vezavo TFIID na polje TATA.

Slika 01: Splošni faktorji transkripcije

Zgoraj navedeni splošni transkripcijski faktorji so specifični za RNA polimerazo II, ki je vrsta RNA polimeraze, ki podaljša pramen mRNA. Obstajajo splošni faktorji transkripcije, ki sodelujejo z RNA polimerazo I in III. Splošni faktorji transkripcije se lahko razlikujejo tudi glede na vrsto celice, na katero deluje.

Kaj so specifični transkripcijski faktorji?

Specifični transkripcijski faktorji so regije, ki se nahajajo tudi v zaporedjih DNK. Večinoma so ali ojačevalci ali zatiralci. Specifični transkripcijski faktorji so specifični cis-delujoči elementi v predlogu DNA šablona, ​​ki se prepisujejo. Aktivacija teh specifičnih ojačevalcev in zaviralcev sodeluje pri povečanju afinitete encima s spreminjanjem orientacije molekule DNA ali z delovanjem kot signalnih regij. Uporabljajo se tudi specifični transkripcijski faktorji za indukcijo sprememb v verigi DNK predloge. Te spremembe večinoma vključujejo kovalentne modifikacije, kot je metilacija. S tem metilirana področja DNA delujejo kot posebna ojačevalca ali zaviralca procesa transkripcije.

Slika 02: Specifični transkripcijski faktorji

Specifični transkripcijski faktorji so odvisni od vrste vrste in jih pogosto ne najdemo v vseh evkariotih. Ti transkripcijski faktorji se preko presnovnih poti poti aktivirajo v različnih presnovnih pogojih. Po aktivaciji uravnavajo ekspresijo gena na transkripcijski ravni.

Kakšne so podobnosti med splošnimi in posebnimi faktorji transkripcije?

• V procesu prepisovanja sta potrebna oba dejavnika.
• Oba dejavnika vplivata na gensko izražanje organizma.
• Oba dejavnika pomagata uravnavati delovanje polimeraze RNA v procesu prepisovanja.
• Oba dejavnika najdemo večinoma v evkariontih.

Kakšna je razlika med splošnimi in posebnimi faktorji transkripcije?

Splošno v primerjavi s specifično transkripcijo
Splošni transkripcijski faktorji so dejavniki, ki se uporabljajo za tvorbo prediniciacijskega kompleksa med postopkom prepisovanja.	Specifični transkripcijski faktorji so bodisi ojačevalci bodisi zaviralci, ki so specifična zaporedja DNK, ki aktivirajo ali potlačijo splošni postopek prepisovanja.
Vrsta molekule
Splošni faktorji transkripcije temeljijo na beljakovinah.	Specifični transkripcijski faktorji so nukleotidna zaporedja.
Tvorba
Splošni transkripcijski faktorji tvorijo kompleks prediniciacije med začetkom transkripcije.	Specifični transkripcijski faktorji delujejo kot ojačevalci ali zaviralci transkripcije.
Vrste
Obstaja šest glavnih vrst; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE in TFIIA splošnih faktorjev transkripcije.	Specifični transkripcijski faktorji so v glavnem kategorizirani kot ojačevalci in zaviralci.

Povzetek - Splošno vs specifični transkripcijski faktorji

Transkripcijski faktorji so bistveni za regulacijo transkripcije in so potrebni za večjo učinkovitost in natančnost postopka. Faktorji transkripcije so dve glavni vrsti; Splošno / bazalno in specifično. Splošni transkripcijski faktorji sodelujejo pri tvorbi kompleksa pred iniciacijo med prepisovanjem, specifični transkripcijski faktorji pa so regije v sami DNK, ki delujejo kot ojačevalci ali zaviralci. Splošni transkripcijski faktorji temeljijo na beljakovinah in jih potrebujejo vsi evkarionti. Ni zelo raznoliko in ostaja enakomerna molekula. Specifični transkripcijski faktor se lahko zelo razlikuje in je odvisen od genetske narave posameznikov. To je razlika med splošnimi in posebnimi faktorji transkripcije.

Prenesite PDF različico splošnih in specifičnih faktorjev transkripcije

Lahko prenesete PDF različico tega članka in jo uporabljate za namene brez povezave, kot je navedeno v navodilu. Prosimo, da tukaj prenesete PDF različico. Razlika med splošnimi in posebnimi faktorji prepisovanja

Referenca:

1.Pulverer, Bernd. "Transkripcijski faktorji, ki vežejo DNA na specifično sekvenco." Nature News, Nature Publishing Group. Na voljo tukaj 
2. "Faktorji transkripcije - Gensko specifični dejavniki, ki diferencialno povečujejo količino prepisovanja." DNA, Bind, Promotor in Binds - Članki iz JRank. Na voljo tukaj  
3. Orfanidi, G in sod. "Splošni faktorji transkripcije RNA polimeraze II." Geni in razvoj, laboratorij Cold Spring Harbor. Na voljo tukaj  

Vljudnost slik:

1.'Preprecijacijski kompleks 'ArneLH - Lastno delo, (CC BY-SA 3.0) prek Commons Wikimedia  
2. „Vloga transkripcijskega faktorja pri regulaciji izražanja genov“ Philippe Hupé - Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Biology of Computational Systems Biology of Cancer Chapman & Hall / CRC Mathematical & Computational Biology, 2012, (CC BY-SA 3.0) prek Wikimedije Commons