Razlika med Gene Knockout in Knockdown

The ključna razlika med genski knockout in knockdown je, da je knockout gen je tehnika, pri kateri se gen, ki ga zanima, popolnoma odstranjen (neoperativno stanje) preučiti funkcije gena knockdown genov je še ena tehnika, pri kateri se utiša gen raziskati vlogo določenega gena v biološkem sistemu.

Za raziskovanje delovanja genov znotraj živih bioloških sistemov delujejo različne genetske tehnike. Genski knockout in knockdown sta dve takšni tehniki. Te tehnike pomagajo znanstvenikom, da prepoznajo funkcionalne vidike različnih genov v živih organizmih.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je gen Knockout
3. Kaj je gen Knockdown
4. Podobnosti med Gene Knockout in Knockdown
5. Primerjava zraven - Gene Knockout vs Knockdown v tabeli
6. Povzetek

Kaj je Gene Knockout?

Genski izpad je genetska tehnika, zaradi katere eden ali več genov v živih organizmih ne deluje. To je tudi postopek izklopa ali brisanja gena organizma. Primarna uporaba te tehnike je proučevanje genske funkcije. Postopek oceni učinek izgubljenega ali odstranjenega gena. Postopek izločanja vključuje tudi nekatere encime in tehnike spajanja.

Slika 01: Gene Knockout

V tehniki izločanja genov je malo različic glede na število vpletenih genov. So dvojni knockout (izločitev dveh genov), trojni knockout (knockout iz treh genov) in štirinožni knockout (knockout štirih genov). Genski izpad je dodatno razvrščen v dve skupini; heterorozni knockouts in homozygous knockouts.

Kaj je Gene Knockdown?

Knockdown gene je eksperimentalni postopek, pri katerem ta postopek zavira ali zmanjša izražanje določenega gena ali genov organizma. Gensko utišanje je skupna opredelitev za ganjenje genov. Med tem postopkom aktiviranje ali razkroj proizvedene mRNA vključuje interfekcijo RNA (RNAi), majhno motečo RNA (siRNA) in RNA s kratkimi lasmi (shRNA).

Slika 02: Gensko molčanje

Primarna uporaba knockdown je raziskovanje vloge posameznega gena v biološkem sistemu. Zato ta tehnika zaključuje preučevanje onkogenov (Bcl-2 in P53) in genov, ki povzročajo nevrološke bolezni, virusne okužbe in dedne bolezni.

Kakšne so podobnosti med Gene Knockout in Knockdown?

• Tako genski knockout kot gen knockdown sta genetska tehnika.
• Ti dve tehniki lahko preprečita izražanje genov.
• Primarna uporaba obeh tehnik je raziskovanje funkcije gena, ki nas zanima.
• Oba sta sposobna prepoznati različna bolezenska stanja (genetska).
• Oboje je mogoče uporabiti za enega ali več genov, ki nas zanimajo.

Kakšna je razlika med Gene Knockout in Knockdown?

Gene Knockout proti Knockdown
Genska izločitev je delovanje genov (odvzem genov iz DNK) organizma z različnimi genetskimi tehnikami.	Gene knockdown je eksperimentalni postopek za zatiranje (zmanjšanje ali utišanje) izražanja določenega gena ali genov organizma.
Funkcija
Olajša proučevanje funkcij genov z analizo rezultatov izgubljenega gena.	Olajša proučevanje onkogenov, genov, ki povzročajo nevrološke bolezni, virusne okužbe in dedne bolezni.
Vključenost agentov RNA
Vključenost RNA povzročiteljev je pri tej tehniki nepomembna.	V postopek vključujejo sredstva, kot so siRNA, shRNA in RNAi, da inaktivirajo mRNA.
Uporaba kemičnih sredstev
Uporabljajo se encimatska sredstva.	Takšnih kemičnih sredstev ne uporabljamo.
Vpliv na gen
Popolnoma odstranjuje gen iz DNK.	Zavirajte ali utišajte gen.
Razvrstitev
Dvojni knockout, trojni knockout in štirikratni knockout ter heterozigoten in homozygous knockout so različne vrste genskega izločanja.	Takih klasifikacijskih sistemov za utišanje genov ni.

Povzetek - Gene Knockout proti Gene Knockdown

O dveh tehnikah, o katerih smo govorili tukaj; genski knockout in knockdown sta metodi za raziskovanje funkcij različnih genov. Gen knockout popolnoma onemogoči gen, medtem ko genski knockdown utiša gen, ki ga zanima. Vendar oba postopka preprečujeta izražanje genov. Ta dva procesa lahko izvajajo različni agenti. Gen knock out je vrsta izbrisa, medtem ko je knockdown gen vrsta inaktivacije. To je razlika med genski knock out in knockdown.

Referenca:

1.Shaffer, Catherine. "Gene Knockout proti knockdownu." News-Medical.net, 12. februar 2018. Dostopno tukaj  
2. "Gene Knockout." Nature News, Nature Publishing Group. Na voljo tukaj

Vljudnost slik:

1.'Knock Mice5006-300'B Maggie Bartlett, NHGRI. (Javna domena) prek Wikimedije Commons 
2.'RNAi-poenostavljeno'My Matzke MA, Matzke AJM (2004) Sajenje semen nove paradigme. PLoS Biol 2 (5): e133 doi: 10.1371 / journal.pbio.0020133., (CC BY 2.5) prek Commons Wikimedia