Razlika med naprej in povratnim premazom

Ključna razlika - naprej vs Reverse Primer
 

Verižna reakcija polimeraze (PCR) je metoda amplifikacije DNA, ki se uporablja v molekularnih bioloških aplikacijah. Gre za pogosto uporabljeno tehniko, ki naredi na milijone do milijarde kopij posebej zainteresiranega zaporedja DNK. Je in vitro metoda, ki se izvaja v laboratorijih. Tehnika PCR je popolnoma odvisna od komercialno proizvedene DNK polimeraze, imenovane Taq polimeraza. Poleg tega zahteva več drugih komponent in pravilno vzdrževanje temperature. Pomembna sestavina so temeljni premazi. Primerji so kratke sekvence DNK, zasnovane posebej za ciljno zaporedje DNK. Običajno so dolgi približno 20 nukleotidov. Taq polimeraza katalizira dodajanje nukleotidov v predhodno nukleotidno zaporedje. Zato se primerji služijo kot izhodišče za sintezo novih pramenov. Taq polimeraza deluje samo v 5 'do 3' smeri, zato sinteza DNK poteka v isti 5 'do 3' smeri. Ker je DNA dvostrukna, sta v PCR potrebni dve vrsti prajmerjev. Znani so kot sprednji in povratni temeljni premaz. Sprednji in povratni temeljni premazi se imenujejo glede na smer raztezanja temeljnega premaza v DNK, ko pride do sinteze DNK. Napredni temeljni premaz se sproži s protisensko verigo DNA in sproži sintezo + ve verige gena v 5 'do 3' smeri. Reverzni temeljni premaz se čisti s smislom in začne sintezo komplementarnega niza kodirnega niza; ki je -venski niz verige v smeri 5 'do 3'. To je ključna razlika med prednjim in obratnim prajmerjem.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je Forward Primer
3. Kaj je povratni premaz
4. Podobnosti med predhodnim in obratnim premazom
5. Primerjava drug ob drugem - Primer naprej in nazaj v tabeli
6. Povzetek

Kaj je Forward Primer?

Napredna usmeritev je sinteza kodirnega niza ali smiselnega sklopa gena. Taq polimeraza katalizira sintezo novega pramena v 5 'do 3' smeri. Sinteza kodirnega niza se pojavi, kadar se temeljni premaz odžira z nekodiranim ali antisenskim pramenom in se razteza v smeri 5 'do 3'.

Slika 01: Naprej in nazaj temeljni premazi

Primer, ki se zdravi z antisens pramenom ali nekodirajočim pramenom ali šablonsko nitjo, je znan kot sprednji temeljni premaz, saj prednji primer deluje kot izhodišče za sintezo kodiranja ali pozitivnega gena. Napredni temeljni premaz ima kratko nukleotidno zaporedje, ki dopolnjuje 3 'bočni konec protisane niti. Hibridizira z antisenskim pramenom in olajša polimerazo Taq za dodajanje nukleotidov, ki so komplementarni v predlogi šablone.

Kaj je reverzni temeljni premaz?

Reverzni temeljni premaz je kratko zaporedje DNK, ki seže s 3 'koncem čutnega ali kodirnega niza. Reverzni temeljni premaz služi kot izhodišče za sintezo komplementarnega niza kodirnega zaporedja ali nekodirajočega zaporedja. Povratni temeljni premaz je zasnovan kot dopolnilo 3 'koncu kodirnega niza. Zato se odzrači s stranskim 3 'koncem kodirnega niza in omogoča polimerazi Taq sintetizirati protismiselno ali predlogo predloge. Ker je njegova orientacija obrnjena, je ta temeljni premaz označen kot povratni temeljni premaz.

Tako vzvratni kot naprej osnovni premazi so pomembni za izdelavo milijonov ali milijard kopij določenih regij DNK, ki so ciljno usmerjene ali zainteresirane.

Kakšne so podobnosti med Forward in Reverse Primer?

• Naprej in nazaj temeljni premazi so narejeni iz oligonukleotidov.
• Tako naprej, kot povratni primeri imajo kratka nukleotidna zaporedja, ki se dopolnjujejo do stranskih koncev dvojnih verig DNK.
• Tako naprej kot nazaj sestavljajo 20 nukleotidov.
• Za verižne reakcije s polimerazo se uporabljajo tako prednji kot tudi povratni osnovni premazi.
• Predhodni in povratni osnovni premazi se sintetizirajo komercialno.
• Predhodni in vzvratni osnovni premazi so temperaturno stabilni in imajo običajno podoben Tm.
• Prehodni in povratni primeri se odstranijo s ciljnimi sekvencami DNK.
• Predhodni in povratni osnovni premazi so zasnovani glede na reakcije PCR.
• Predhodni in povratni temeljni premazi služijo kot izhodišče za pomnoževanje DNK.
• Tako povratni kot zadnji prajmerji so pomembni za izdelavo milijonov kopij določenih regij ciljanih ali zainteresiranih sekvenc DNK.

Kakšna je razlika med naprednim in obratnim premazom?

Forward Primer vs Reverse Primer
Napredni primer je kratko zaporedje DNA, ki se hibridizira s 3 'koncem nekodirajočega ali šablonskega gena in služi kot izhodišče za sintezo kodirnega zaporedja.	Reverzni osnovni premaz je kratko zaporedje DNK, ki se hibridizira s 3 'koncem kodiranja ali netemplatirnega niza in služi kot izhodišče za sintezo nekodirajočega zaporedja.
Žarilni pramen
Predhodne temeljne žaritve s šablono.	Reverzne temeljne žaritve sežejo s pramenom, ki ni predlogo.
Rezultat novega zaporedja
Naprej osnovni premaz olajša sintezo kodirnega zaporedja.	Reverse primer olajša sintezo nekodirajočega zaporedja.

Povzetek - Posreduj vs Reverse Primer

V tehniki PCR obstajata dve vrsti temeljnih premazov. Gre za premik naprej in nazaj. Na osnovi raztezanja temeljnega premaza v sintezi novih verig DNA so ti prajmerji označeni ali poimenovani. Taq polimeraza sintetizira novo DNK v 5 'do 3' orientaciji. Zato so osnovni premazi oblikovani kot dopolnilo 3 'koncem dvojnih pramenov. Naprej osnovni premaz, ki se razteza v 5 'do 3' smeri, se hibridizira s 3 'koncem antisense ali predloge ali nekodirajočega zaporedja. Služi kot izhodišče za sintezo kodirnega zaporedja. Povratni temeljni premaz, ki se razteza v smeri 5 'do 3', se hibridizira s 3 'koncem kodiranja ali netemplatom ali smiselnim pramenom. Služi kot izhodišče za sintezo nekodirajočega zaporedja. To je razlika med naprej in nazaj temeljnim premazom.

Referenca:

1. "Primer (Molekularna biologija)." Wikipedia, fundacija Wikimedia, 20. februar 2018. Na voljo tukaj 
2. "Verižna reakcija polimeraze (PCR)." Akademija Khan. Na voljo tukaj 

Vljudnost slik:

1.'Primers RevComp Melted2'Byy Richard Wheeler (Zephyris) - Lastno delo, (CC BY-SA 3.0) prek Commons Wikimedia