Razlika med Cosmidom in Phagemidom

The ključna razlika med Cosmidom in Phagemidom je na vrsti zaporedij, ki jih vsebuje. Cosmid vsebuje cos mesto in plazmid. Torej je hibridni vektor, medtem ko je Phagemid plazmid, ki vsebuje izvor F1 podvajanja faga F1.

Cosmidi in Phagemidi se uporabljajo za kloniranje, zlasti za kloniranje večjih fragmentov DNK. Te se pogosto uporabljajo predvsem pri kloniranju genov, odgovornih za proizvodnjo različnih beljakovin. Kozmidi in fagemidi se bodisi sami replicirajo kot plazmidi bodisi pakirajo v virusne delce in nato ponovijo.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je Cosmid
3. Kaj je fagemid
4. Podobnosti med Cosmidom in Phagemidom
5. Primerjava ob strani - Cosmid proti Phagemidu v tabeli
6. Povzetek

Kaj je Cosmid?

Cosmid, ki ga imenujemo hibridni plazmid, obsega cos mesta, ekstrahirana iz delcev faze Lambda, in plazmid. Ta mesta so dolgi delci DNK z 200 osnovami. Zato imajo kohezivne ali lepljive konce, ki omogočajo, da se plazmid prilepi v virusno DNK. Zato so cos mesta ključnega pomena za pakiranje DNK.

Obstajajo tri cos mesta;

• cosN mesto - vključeno v nikiranje verige DNA z aktivnostjo terminaze
• spletno mesto cosB - ki se ukvarja z držanjem terminaze.
• cosQ mesto - sodeluje pri preprečevanju razgradnje DNK z DNazami.

Slika 01: Cosmid

Tudi Cosmidi lahko kopirajo enoverižno ali dvoverižno DNK z uporabo ustreznega izvora replikacije. Kozmidi običajno vsebujejo gene proti antibiotičnim receptorjem kot markerje za izbiro transformantov. Tako lahko uporaba kozmida kot vektorja olajša kloniranje in restriktivni encim prebava vektorja lahko nato izloči te fragmente.

Kaj je fagemid (Fazmid)?

Phagemid, imenovan tudi kot Fazmid, je tudi vrsta hibridnih vektorjev. Phagemid vsebuje poseben izvor podvajanja, ki ga imenujemo f1 izvor podvajanja. Izvor replike f1 izvleče iz faga f1.

Phagemid lahko posnema enojno in dvoverižno DNK. Razmnoževanje lahko poteka kot plazmid med samostojno replikacijo ali pakira v fagne delce in končno okuži bakterijo E coli. Ko okužijo E coli celic, faz f1 zahteva prisotnost blazinice. Zato so spolni pili med tem pomembni in vitro embalaža Phagemidov.

Kakšne so podobnosti med Cosmidom in Phagemidom?

• Cosmid in Phagemid sta klonirana vektorja, ki se uporabljata v tehnologiji rekombinantne DNA.
• Cosmid in Phagemid lahko podvajata enoverižno in dvoverižno DNK.
• Obe sta lahko podvrženi neodvisni replikaciji, podobni plazmidom.
• Cosmid in Phagemid se lahko podvržeta in vitro embalažo in okužijo bakterijske celice.
• Cosmid in Phagemid za kloniranje zahtevata primeren izvor razmnoževanja.

Kakšna je razlika med Cosmidom in Phagemidom?

Cosmid proti Phagemidu
Cosmid je hibridni vektor, ki vsebuje cos mesto in plazmid.	Phagemid je plazmid, ki vsebuje F1 izvor podvajanja F1 faga.
Prisotnost Cos Sites
Cos mesta so v kozmidu in so potrebna za in vitro pakiranje.	Cos mesta so v fagemidu odsotna.
Prisotnost F1 izvora replikacije
V kozmidu lahko izvor razmnoževanja fi ali ne obstaja.	Izvor razmnoževanja F1 je prisoten v fagemidu.
Prisotnost antibiotičnih rezistentnih genov
V kozmidih so prisotni geni, odporni proti antibiotikom, da prepoznajo transformante iz ne-transformatorjev.	Geni, odporni na antibiotike, v fagemidih niso na voljo.
Zahteva in vitro embalaže
Zahteva spletno mesto cos.	Zahteva spolni vzglavnik.

Povzetek - Cosmid vs Fagemid

Cosmid in Phagemid sta klonirana vektorja, ki se uporabljata v tehnologiji rekombinantne DNA. Cosmidi so hibridni vektorji, ki vsebujejo posebne lepljive konce, znane kot cos mesta. in vitro embalaža zahteva ta mesta. Medtem ko so fagemidi plazmidi, ki vsebujejo f1 izvor razmnoževanja, ekstrahiranega iz f1 faga. Tako kozmid kot fagemid se lahko podvržeta neodvisni podvajanju oz in vitro pakiranje na bakterijske celice. To so pomembne razlike med kozmidom in fagemidom.

Referenca:

1.Qi, H in sod. "Fagemidski vektorji za prikaz fagov: lastnosti, lastnosti in konstrukcija." Journal of Molecular Biology., Ameriška nacionalna medicinska knjižnica, 30. marec 2012. Na voljo tukaj 
2.Collins, J in B Hohn. "Cosmidi: vrsta vektorja za kloniranje genskega plazmida, ki ga je mogoče pakirati in vitro za glave bakteriofaga Lambda." Zborniki Nacionalne akademije znanosti Združenih držav Amerike, ameriška Nacionalna medicinska knjižnica, september 1978. Na voljo tukaj  

Vljudnost slik:

1.'Cosmid (angleščina) 'Zlir'a (CC0) prek Wikimedije Commons