Razlika med vezanjem s kromosomom in kromosomskim slikanjem

The ključna razlika med kromosomskim pasom in kromosomsko sliko je to kromosomsko vezanje je tehnika obarvanja, ki prikazuje regije kromosomov v prepoznavnih temnih in svetlih pasovih, vendar je kromosomska slika hibridizacijska tehnika, v kateri so določene regije ali segmenti kromosomov naslikane s specifičnimi fluorescentno označenimi sondami.

V citogenetiki je potrebno izdelati viden kariotip organizma, da se prepoznajo kromosomi in njihove aberacije. Hromosomsko vezanje in slikanje kromosomov sta dve citogenetski tehniki, ki pomagata pri vizualizaciji kromosomov. Obe tehniki sta uporabni pri prepoznavanju genetskih motenj.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je kromosomski pas 
3. Kaj je kromosomsko slikanje
4. Podobnosti med vezanjem s kromosomom in slikanjem s kromosomom
5. Primerjava ob strani - slikanje kromosomov in slik s kromosomom v tabeli
6. Povzetek

Kaj je kromosomski pas?

Hromosomski pas je tehnika obarvanja, ki prikazuje izmenične svetlobne in temne pasove ali področja vzdolž dolžine kromosoma. Pas se nanaša na del kromosoma, ki se jasno razlikuje od njegovih sosednjih segmentov, tako da izgleda temnejši ali svetlejši. Za nastanek temnih in svetlih pasov je potrebno kromosome obarvati s primernim barvilom, kot je fluorescentno barvilo kinacrin ali Giemsa madež.

Obstaja več vrst tehnik kromosomskega vezanja. Med njimi so Q-banding, Reverse R in G-bending posplošene tehnike pasovanja. Tehnika G vezanja uporablja madež, imenovan Giemsa madež, in obarva AT-bogate regije heterokromatičnih regij v temno obarvanih pasovih in GC bogate evromatične regije v rahlo obarvanih pasovih. R trak je obratno od pasov G in obarva območja, bogata z GC, v temnih pasovih in AT-bogata območja v svetlih pasovih. Po drugi strani Q-pas uporablja fluorescenčno barvilo kinacrin in obarva kromosome v rumeno fluorescenco različne intenzivnosti. Tehnika vezanja C je še ena tehnika vezanja, ki obarva regije centromere. Poleg tega tehnika T vezanja vizualizira regije telomer.

Slika 01: Hromosomski pas

Vzorec vezanja je edinstven za organizme. Zato so ti edinstveni pasovni vzorci pomembni pri prepoznavanju kromosomov in odkrivanju kromosomskih aberacij (lomljenje kromosomov, izguba, podvajanje, premestitev ali obrnjeni segmenti).

Kaj je slikanje s kromosomom?

Slikanje s kromosomom je tehnika, pri kateri se določene regije ali segmenti kromosomov pobarvajo s sondami, značilnimi za zaporedje, ki so fluorescentno označene. Zato je kromosomsko slikanje vedno povezano in situ RIBI tehnika. Popolnoma temelji na molekularni hibridizaciji s sonde, specifičnimi za sonde, na kromosomih. Zato potrebuje posebne sonde, da hibridizira ciljne kromosome ali regije kromosomov.

Slika 02: Kromosomsko slikanje

Poleg tega ta tehnika sprva zahteva denaturacijo ciljne kromosomske DNK, ki je v metafazi. Drugič, korak hibridizacije poteka s sondami. Ko sonde najdejo svoje komplementarne sekvence, se hibridirajo s specifičnimi območji kromosoma. Hibridizirana mesta zlahka opazujemo z avtoradiografijo ali imunofluorescenco. Priprava sond, denaturacija, hibridizacija in vizualizacija so štirje glavni koraki kromosomskega slikanja.

Kar zadeva aplikacije, je kromosomsko slikanje koristno pri prepoznavanju kromosomskih preureditev, prelomnih točk in pri določanju ekstrahromosomskih materialov. Poleg tega je močno orodje za natančno lokalizacijo različnih genskih zaporedij kromosomov na mikroskopski ravni. Poleg tega je kromosomsko slikanje koristno pri identifikaciji genov za želene znake v kromosomih.

Kakšne so podobnosti med vezanjem s kromosomom in slikanjem s kromosomom?

• Hitroosomsko vezanje in slikanje kromosomov sta dve tehniki, ki se uporabljata pri citogenetski analizi.
• Obe tehniki vizualizirata kromosome običajno v metafazi.
• Te tehnike lahko prepoznajo normalne kromosome in aberacije.
• Poleg tega so te tehnike res koristne pri prepoznavanju genetskih motenj.

Kakšna je razlika med vezanjem s kromosomom in slikanjem s kromosomom?

Hromosomsko vezanje je tehnika obarvanja, ki prikazuje dele kromosomov v temnih in svetlih pasovih, ki jih je mogoče razlikovati. Medtem je kromosomsko slikanje hibridizacijska tehnika, ki s posebnimi sondami, ki so fluorescenčno označene, barva določena področja kromosomov. Torej, to je ključna razlika med vezanjem kromosomov in kromosomskim slikanjem. Poleg tega kromosomski pas povzroča izmenične temne in svetle pasove vzdolž dolžine kromosoma, medtem ko kromosomska slika ustvarja fluorescenčno označena področja kromosomov.

Poleg tega je vezanje kromosomov odvisno od sposobnosti kromosomske DNK, da obarva z barvilom, medtem ko je kromosomska slika odvisna od molekularne hibridizacije s sonde, značilnih za zaporedje, na kromosomih. To je pomembna razlika med vezanjem kromosomov in kromosomskim slikanjem. Poleg teh, za razliko od kromosomskega vezanja, tehnika kromosomskega slikanja zahteva fluorescentno označene sonde, ki so značilne za zaporedje.

Povzetek - Hromosomski pas proti kromosomskemu slikanju

Kromosomsko vezanje in slikanje kromosomov sta dve tehniki, ki se uporabljata za vizualizacijo kromosomov, običajno v metafazi. Obe tehniki pomagata prepoznati numerične in strukturne kromosomske aberacije in genetske bolezni. Hromosomsko vezanje je tehnika obarvanja, ki prikaže posebne regije kromosomov v temnih in svetlih pasovih, ki jih je mogoče razlikovati. Medtem je kromosomsko slikanje vrsta hibridizacijske tehnike, ki vizualno predstavi specifična področja kromosomov zaradi hibridizacije s fluorescentno označenimi zaporedji sondami. Torej, to je ključna razlika med vezanjem kromosomov in kromosomskim slikanjem.

Referenca:

1. Thomas, et al. "Slikanje s kromosomom: uporabna umetnost." OUP Academic, Oxford University Press, 1. septembra 1998, na voljo tukaj.
2. "Povezava G." Wikipedia, fundacija Wikimedia, 19. januar 2020, dostopno tukaj.

Vljudnost slik:

1. "NHGRI človeški moški kariotip" Nacionalnega inštituta za raziskovanje človeškega genoma - (Public Domain) prek Commons Wikimedia
2. „Kariotip žirafe (Giraffa camelopardalis)“ Anastasia I Kulemzina, Polina L Perelman, Daria A Grafodatskaya, Trung T Nguyen, Mary Thompson, Melody E Roelke-Parker in Alexander S Graphodatsky - Kulemzina AI, Perelman PL, Grafodatskaya et al. Primerjalno kromosomsko slikanje pronghorna (Antilocapra americana) in saole (Pseudoryx nghetinhensis) kariotipov s človeškimi in dromedarnimi sondami kamel. BMC genetika. 2014; 15: 68. doi: 10.1186 / 1471-2156-15-68. (CC BY 2.0) prek Wikimedije Commons