Razlika med Alpha Helix in Beta Pleated Sheet

Ključna razlika - Alpha Helix vs Beta Pleated Sheet
 

Alpha helices in beta plisirani listi so dve najpogosteje najdeni sekundarni strukturi v polipeptidni verigi. Ti dve strukturni komponenti sta prva glavna koraka v postopku zlaganja polipeptidne verige. The ključna razlika med Alpha Helix in Beta Pleated Sheet je v njihovem zgradba; imajo dve različni obliki, da opravijo točno določeno delo.

Kaj je Alpha Helix?

Alfa vijačnica je desna tuljava aminokislinskih ostankov na polipeptidni verigi. Obseg aminokislinskih ostankov se lahko razlikuje od 4 do 40 ostankov. Vodikove vezi, ki nastanejo med kisikom C = O skupine na zgornji tuljavi in ​​vodikom N-H skupine spodnje tuljave, pomagajo, da tuljavo držijo skupaj. Na vsake štiri ostanke aminokislin v verigi nastane vodikova vez na zgoraj navedeni način. Ta enoten vzorec daje določene lastnosti, kot je debelina tuljave, in narekuje dolžino vsakega celotnega zavoja vzdolž osi vijačnice. Stabilnost strukture alfa vijačnice je odvisna od več dejavnikov.

O atomi v rdeči, N atomi v modri in vodikove vezi kot zelene pikčaste črte

Kaj je Beta naguban list?

Beta nagubana pločevina, znana tudi kot beta lista, velja za drugo obliko sekundarne strukture v beljakovinah. Vsebuje beta pramene, ki so bočno povezani z najmanj dvema ali tremi hrbteničnimi vodikovimi vezmi, da tvorijo zvit, plisiran list, kot je prikazano na sliki. Beta nit je del polipeptidne verige; njegova dolžina je na splošno enaka 3 do 10 aminokislinam, vključno s hrbtenico v razširjeni potrditvi.

4-verižni antiparalni β fragment lista iz kristalne strukture encima katalaza.
a) prikazovanje protiparalnih vodikovih vezi (pikčanih) med peptidnimi skupinami NH in CO na sosednjih pramenih. Puščice kažejo smer verige, konture gostote elektronov pa začrtajo atome, ki niso H. O-atomi so rdeče kroglice, N-atomi so modri, H-atomi so zaradi preprostosti izpuščeni; stranske verige so prikazane samo prvemu atomu stranske verige C (zelena)
b) Pogled na osrednja dva β pramena z roba

V betoniziranih listih polipeptidne verige potekajo drug ob drugem. Poimenovan je „naguban list“ zaradi valovitega videza strukture. Povezani so skupaj z vodikovimi vezmi. Ta struktura omogoča oblikovanje več vodikovih vezi z raztezanjem polipeptidne verige.

Kakšna je razlika med Alpha Helix in Beta Pleated Sheet?

Struktura Alpha Helix in Beta nagubanega lista

Alpha Helix:

V tej strukturi je polipeptidna hrbtenica tesno vezana okoli namišljene osi kot spiralna struktura. Znana je tudi pod imenom helikoidna ureditev peptidne verige.

Nastanek alfa vijačne strukture se zgodi, ko se polipeptidne verige zvijejo v spiralo. To omogoča vsem aminokislinam v verigi, da tvorijo vodikove vezi (vez med molekulo kisika in molekulo vodika) med seboj. Vodikove vezi omogočajo, da spirala drži spiralno obliko in daje tesno tuljavo. Ta spiralna oblika naredi alfa vijačnico zelo močno.

Vodikove vezi so označene z rumenimi pikami.

Beta naguban list:

Ko se dva ali več fragmentov polipeptidnih verig (-ov) prekrivata, tvorita vrsto vodikovih vezi med seboj, lahko najdemo naslednje strukture. Lahko se zgodi na dva načina; vzporedna razporeditev in proti-vzporedna ureditev.

Primeri strukture:

Alpha Helix: Kot primer strukture alfa vijačnice lahko vzamemo nohte ali nohte.

Beta naguban list: Struktura perja je podobna strukturi betoniranega lista.

Značilnosti strukture:

Alpha Helix: V strukturi alfa vijačnice je 3,6 aminokislin na zavoj vijačnice. Vse peptidne vezi so trans in planarne, skupine N-H v peptidnih vezah pa v isti smeri, ki je približno vzporedna z osjo vijačnice. Skupine C = O vseh peptidnih vezi kažejo v nasprotni smeri in so vzporedne z osjo vijačnice. C = O skupina vsake peptidne vezi je vezana na N-H skupino peptidne vezi, ki tvori vodikovo vez. Vse skupine R so obrnjene navzgor od vijačnice.

Beta naguban list: Vsaka peptidna vez na betoniziranem listu je ravna in ima transkonformacijo. Skupini C = O in N-H peptidnih vezi iz sosednjih verig sta v isti ravnini in se usmerjata drug proti drugemu, tvorita vodikovo vez med njima. Vse R- skupine v kateri koli verigi se lahko pojavijo nad in pod ravnino lista.

Opredelitve:

Sekundarna zgradba: oblika zložljivega beljakovine je zaradi vodikove vezi med amidno in karbonilno skupino hrbtenice.

Literatura: "Struktura beljakovin". ChemWiki: Hipertekst dinamične kemije "Sekundarna struktura beljakovin: α-Helices in β-Sheets". Proteinstructures.com Salam Al Karadaghi "Organska kemija". Virtualni učbenik za celice "Beta Sheet" .Wikipedia Image Courtesy: "Mioglobin elektronske gostote Helix 2nrl 17-32" avtor Dcrjsr - Lastno delo (CC BY 3.0) prek Commons Wikimedia "Protein second structure" avtor: en: Uporabnik: Bikadi (CC BY -SA 3.0) prek Commons Wikimedia »1gwe antipar beta Sheet oboje« avtorja Dcrjsr - Lastno delo (CC BY 3.0) prek Commons Wikimedia