Razlika med 1D in 2D gelo elektroforezo

The ključna razlika med 1D in 2D gel elektroforezo so lastnosti, ki se uporabljajo za ločevanje beljakovin na gel elektroforezi. 1D gel elektroforeza loči le beljakovine na osnovi molekulske mase, medtem ko 2D gel elektroforeza loči beljakovine glede na njeno izoelektrično točko in molekulsko maso.

Ločevanje beljakovin z elektroforezo z geli je pomembna tehnika za karakterizacijo beljakovin. Beljakovine imajo različne lastnosti; zato je ločitev bolj zapletena v primerjavi z ločevanjem DNK z elektroforezo gela Agarose.

VSEBINA

1. Pregled in ključne razlike
2. Kaj je 1D gel elektroforeza
3. Kaj je 2D gel elektroforeza
4. Podobnosti med 1D in 2D gelo elektroforezo
5. Primerjava drug ob drugem - 1D v primerjavi z 2D gelo elektroforezo v tabeli
6. Povzetek

Kaj je 1D gel elektroforeza?

1D gel elektroforeza, znana tudi kot enodimenzionalna gel elektroforeza, je metoda ločevanja beljakovin, ki temelji na molekulski masi. Ločevanje beljakovin poteka predvsem s pomočjo elektroforeze poliakrilamidnega gela. Na osnovi koncepta gel elektroforeze se molekule ločijo po svoji lastnosti molekularne mase in naboja.

Zato, da se beljakovinam enakomerno napolni, pred gelično elektroforezo opravimo zdravljenje z natrijevim dodecil sulfatom (SDS). SDS denaturira beljakovine in zagotavlja enakomeren negativni naboj proteina; Ko pride do uporabe električnega polja, se proteini premaknejo na pozitiven terminal glede na njihovo molekulsko maso. Tako pri ločevanju šteje samo ena lastnost. Zato to metodo imenujemo 1D gel elektroforeza.

Slika 01: 1D gel elektroforeza

Med 1D gelfoforezo se proteini ločijo glede na njihovo molekulsko maso. Glede na to se molekule z manjšo težo hitreje selijo v gelu v primerjavi z beljakovinami z visoko molekulsko maso. Tako beljakovine z veliko težo ostanejo blizu vdolbinic.

Kaj je 2D gel elektroforeza?

2D gel elektroforeza ali dvodimenzionalna gel elektroforeza ločuje beljakovine na podlagi dveh lastnosti. Obe lastnosti sta izoelektrična točka proteina in molekulska teža. Ta metoda ločevanja beljakovin poveča ločljivost ločevanja beljakovin. Izoelektrična točka proteina je odvisna od pH, pri katerem je protein nevtralen.

Slika 02: 2D gel elektroforeza

Tako pri 2D gel elektroforezi pustimo, da v prvi dimenziji beljakovine tečejo s fiksnim pH gradientom. V drugi dimenziji se proteini ločijo z vertikalno ali vodoravno poliakrilamidno elektroforezo. Tako se proteini ločijo glede na njihovo molekulsko maso v drugi dimenziji.

Poleg tega ta metoda gel elektroforeze poveča ločljivost beljakovin. Zato so ločene beljakovine čistejše. Vendar so stroški tehnike veliko višji od enodimenzionalne gel elektroforeze.

Kakšne so podobnosti med 1D in 2D gelo elektroforezo?

• Obe tehniki ločujeta beljakovine.
• Zato so pomembne pri karakterizaciji beljakovin.

Kakšna je razlika med 1D in 2D gelo elektroforezo?

Ključna razlika med 1D in 2D gel elektroforezo je, da 1D gel elektroforeza loči beljakovine le na osnovi molekulske mase, medtem ko 2D gel elektroforeza loči beljakovine na osnovi izoelektrične točke in molekulske mase. Zaradi te osnovne razlike med 1D in 2D gel elektroforezo se ločljivost beljakovin in stroški teh dveh tehnik tudi razlikujejo. 2D gel elektroforeza kaže visoko ločljivost kot 1D gel elektroforeza. Vendar je 2D gel elektroforeza dražja od 1D gel elektroforeze.

Spodaj infografika povzema razliko med 1D in 2D gel elektroforezo.

Povzetek - 1D v primerjavi z 2D gelo elektroforezo

Ločitev beljakovin temelji na številnih dejavnikih. 1D gel elektroforeza loči beljakovine na osnovi samo molekulske mase. Vendar pa dvodimenzionalna ali dvodimenzionalna elektroforeza poveča ločljivost beljakovin. Nadalje 2D gel elektroforeza loči beljakovine glede na izelektrično točko in molekulsko maso. Zato so ti podatki pomembni za nadaljnjo predelavo beljakovin in na področju proteomike. Tako je to povzetek razlike med 1D in 2D gel elektroforezo.

Referenca:

1. Galeva, Nadežda in MichailAltermann. "Primerjava enodimenzionalne in dvodimenzionalne gel-elektroforeze kot orodja za ločevanje za proteomsko analizo mikrosomov jeter podgane: citokromov P450 in drugih membranskih beljakovin." Proteomics, ameriška nacionalna medicinska knjižnica, junij 2002, dostopno tukaj.

Vljudnost slik:

1. "Elektroforeza - polnjenje 1D gelastih vdolbinic z mešanico beljakovin" Jean-Etienne Poirrier - polnjenje 1D gelovskih vdolbinic z mešanico beljakovin (CC BY-SA 2.0) prek Commons Wikimedia
2. "2D elektroforeza" Nacionalnega inštituta za zdravje - Center za raziskave raka nanobiologijo, Nacionalni inštitut za zdravje (Public Domain) prek Commons Wikimedia