Beseda Protoplazma izhaja iz grške besede "protos", kar pomeni najprej in "plazma", kar pomeni "stvari, ki so nastale". Protoplazma velja za fizično osnovo življenja. Protoplazma celice je sestavljena iz jedra, celične membrane in citoplazme. Tako je citoplazma del protoplazme celice. Citoplazma se ne razlikuje od protoplazme, ampak je njen del. Citoplazma in protoplazma sta celični suspenziji in zagotavljata mesto, tako da potekajo biološki procesi. Protoplazmo na vseh straneh veže plazemska membrana ali celična membrana, medtem ko je citoplazma snov, ki je prisotna okoli jedra znotraj celice.
Citoplazma je sestavljena iz citosola, organelov in vključkov, medtem ko protoplazmo sestavljajo citoplazma, jedro in celična membrana. Citosol citoplazme je sestavljen iz vode, soli in organskih molekul. Organele so drobne strukture, podobne organom, prisotne v celici z vnaprej določenimi in specifičnimi funkcijami. Vključki so netopni delci, prisotni v citoplazmi.
Protoplazma velja za živo snov znotraj celice. Je zapletena, prosojna snov, ki je polteče po konsistenci in je sestavljena predvsem iz nukleinskih kislin, beljakovin, lipidov, ogljikovih hidratov in anorganskih soli.
Glavna razlika med citoplazmo in protoplazmo je v tem, da citoplazma nima jedra, protoplazma pa ima jedro. Citoplazma je organela protoplazme, ki jo sestavljajo predvsem voda in druge snovi, kot so beljakovine, rezerve hrane in presnovni odpadki.
Protoplazma je viskozna, viskozna snov z želeno podobno konsistenco, kjer potekajo številni biološki in kemični celični procesi. V organizmih, ki imajo jedro, se protoplazma, ki obdaja jedro, imenuje citoplazma. Vsa vsebina celice se v citoplazmi šteje v prokariotih (organizmi, ki nimajo jedra), medtem ko je v evkariotskih organizmih celična vsebnost v jedru ločena od citoplazme z določeno jedrsko membrano. Vsebine, prisotne v jedru, imenujemo nukleoplazma.
Anorganske snovi, ki sestavljajo protoplazmo, so predvsem voda, mineralne soli in plini.
Organele, prisotne v citoplazmi, so telo golgi, mitohondriji, endoplazemski retikulum in ribosomi. Te organele imajo zelo specifične in različne funkcije. Mitohondriji imajo funkcijo celičnega dihanja, medtem ko ribosomi delujejo kot mesta sinteze beljakovin. Druge pomembne funkcije, ki se pojavljajo v citoplazmi, so glikoliza in procesi celične delitve. Protoplazma velja tudi za živi del celice, saj se vsi pomembni procesi, potrebni za življenje celice, odvijajo v protoplazmi. Prav tako naj bi protoplazma dala organizmu obliko, saj je prosojna, viskozna in vodnata snov. Živa protoplazma se odziva na dražljaje in se tudi znebi izločilnih produktov.
Razlika med protoplazmo in citoplazmo je zelo majhna. Protoplazma je vsebnost celice, ki vključuje celično membrano, citoplazmo in celično jedro, medtem ko je citoplazma želeju podobna snov, ki obdaja jedro znotraj celične membrane. Citoplazma vsebuje celične organele kot mitohondrije, ribosome itd. V prokariotih, kjer ni jasno definiranega jedra, citoplazma deluje tudi kot nukleoplazma in vsebuje kromatin.